[发明专利]DNA条形码、引物、试剂盒、方法和应用在审
申请号: | 201910168842.0 | 申请日: | 2019-03-06 |
公开(公告)号: | CN111662995A | 公开(公告)日: | 2020-09-15 |
发明(设计)人: | 徐丹洋;施佳辉;徐平;唐蜀昆;高林瑞;田飞;高慧英;职晓阳;丁章贵 | 申请(专利权)人: | 勐海茶业有限责任公司;云南大益微生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/686;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/685 |
代理公司: | 北京天昊联合知识产权代理有限公司 11112 | 代理人: | 王静;丁业平 |
地址: | 666200 云南省西双*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | dna 条形码 引物 试剂盒 方法 应用 | ||
1.一种用于鉴别黑曲霉菌株的DNA条形码,该DNA条形码来源于黑曲霉TMCC 70012菌株的基因组,并且包含选自如SEQ ID No.4所示的DNA序列中的至少500bp的序列,并且该DNA条形码的长度为500bp-4000bp,优选为500bp-900bp。
2.根据权利要求1所述的DNA条形码,其核苷酸序列如SEQ ID No.1、SEQ ID No.4或SEQID No.7所示。
3.一种用于扩增权利要求1或2所述的DNA条形码的引物对。
4.根据权利要求3所述的引物对,其正向引物的核苷酸序列与黑曲霉TMCC 70012菌株基因组中的这样的序列相同:该序列为从所述TMCC 70012菌株基因组中如SEQ ID No.4所示的核苷酸序列的第1位到如SEQ ID No.4所示的核苷酸序列的第3510位的区域中的序列,并且该正向引物的长度为15-30bp;其反向引物与所述TMCC 70012菌株基因组中的这样的序列反向互补:该序列为从所述TMCC 70012菌株基因组中如SEQ ID No.4所示的核苷酸序列的第471位到如SEQ ID No.4所示的核苷酸序列的最后一位的区域中的序列,并且该反向引物的长度为15-30bp。
5.根据权利要求4所述的引物对,所述正向引物和反向引物的核苷酸序列分别如下所示:
正向引物:5’-ACGCCTCAGTAGAAGATAGT-3’;
反向引物:5’-CTTGCCATGGTGGTGGGATA-3’。
6.一种用于鉴别黑曲霉菌株的试剂盒,包含根据权利要求3-5中任一项所述的引物对。
7.一种用于鉴别黑曲霉菌株的方法,包括以下步骤:
a)提供待测菌株的基因组DNA;
b)以步骤a)所述的基因组DNA为模板,利用根据权利要求3-5中任一项所述的引物对进行PCR扩增,得到PCR产物;
c)通过琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物,如果没有目标条带,则判定待测菌株不是黑曲霉TMCC 70012菌株,如果有目标条带,则进行步骤d);
d)对所得PCR产物进行测序,得到待测核苷酸序列;将所述待测序列与权利要求1或2所述的DNA条形码的核苷酸序列进行同源性比对,若同源性在97%以上,则判定待测菌株是黑曲霉TMCC 70012菌株。
8.根据权利要求1或2所述的DNA条形码在鉴别黑曲霉菌株中的应用。
9.根据权利要求3-5中任一项所述的引物对在鉴别黑曲霉菌株中的应用。
10.根据权利要求6所述的试剂盒在鉴别黑曲霉菌菌株中的应用。
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