[发明专利]智能DNA条形码的细菌核酸测序鉴定系统及方法在审
申请号: | 201910171221.8 | 申请日: | 2019-03-07 |
公开(公告)号: | CN109722484A | 公开(公告)日: | 2019-05-07 |
发明(设计)人: | 于维森;石学香;杜惠琴;牛娟娟 | 申请(专利权)人: | 青岛市疾病预防控制中心(青岛市预防医学研究院) |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/686;C12Q1/04 |
代理公司: | 北京科亿知识产权代理事务所(普通合伙) 11350 | 代理人: | 汤东凤 |
地址: | 266033 *** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 测序鉴定 细菌核酸 标准核酸 细菌 序列数据库 智能 共性描述 核酸测序 技术研究 鉴定技术 生物领域 食品安全 中毒事件 食物中毒 测序 构建 录入 膳食 溯源 判定 数据库 病毒 分解 细胞 检测 预防 统一 | ||
1.一种智能DNA条形码的细菌核酸测序鉴定系统,包括提取模块、数据生成模块和数据检测模块,所述提取模块包括细菌核酸提取纯化和细菌核酸测序运作,所述数据生成模块包括细菌核酸DNA的序列生成以及细菌核酸DNA的序列拼接,所述数据检测模块包括细菌DNA序列的数据对比鉴定。
2.根据权利要求1所述的智能DNA条形码的细菌核酸测序鉴定系统,其特征在于:所述数据对比检测模块包括数据库,所述数据库与数据对比鉴定模块进行双向连接。
3.根据权利要求1所述的智能DNA条形码的细菌核酸测序鉴定系统,其特征在于:所述数据生成模块在DNA序列数据生成后直接通过数据检测模块进行对比鉴定检测。
4.一种智能DNA条形码的细菌核酸测序鉴定方法,包括以下步骤:
S1、获取并培养获得需要进行鉴定的细菌菌株;
S2、提取步骤一获得的细菌菌株的基因组DNA;
S3、使用通用核酸测序引物对PCR扩增菌株特定序列;
S4、提取并纯化PCR产物;
S5、测定并生成步骤四得到的PCR产物的核酸序列;
S6、应用序列分析软件进行序列拼接,以通用核酸测序引物对定位,去除引物区,获得相应片段的DNA序列;
S7、将步骤六相应片段的DNA序列与数据库中的资料进行序列对比,对细菌进行鉴定,然后自动生成鉴定结果。
5.根据权利要求4所述的智能DNA条形码的细菌核酸测序鉴定方法,其特征在于:所述DNA核酸序列在进行序列比对分析时,首先选择具有鉴定和分类意义的核酸序列片段,并根据保守区域核酸序列设计通用核酸测序引物对。
6.根据权利要求4所述的智能DNA条形码的细菌核酸测序鉴定方法,其特征在于:所述细菌的基因组DNA的提取和纯化采用溶菌酶、十二烷基硫酸钠、十六烷基三甲基溴化铵进行菌体破碎;采用苯酚-氯仿-异戊醇、乙醇沉淀核酸,获得符合质量控制要求的基因组DNA。
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