[发明专利]智能DNA条形码的细菌核酸测序鉴定系统及方法

说明书

本发明公开了一种智能DNA条形码的细菌核酸测序鉴定系统及方法，涉及DNA测序鉴定技术领域，通过该细菌核酸测序鉴定系统及方法，方便了人们快速对食物中毒源的DNA条形码数据库及其检测鉴定溯源的技术研究，保障了食品安全、指导人们膳食选择、预防中毒事件的发生，同时建立了常见细菌的核酸测序鉴定方法，为人们在生物领域内的细菌、细胞及病毒的DNA条形码测序和鉴定带来方便，同时DNA基因组在提取和纯化时采用特殊的方式进行操作，避免DNA序列发生分解，且本发明采用构建的标准核酸序列，按照统一的共性描述和规范编码录入细菌核酸测序鉴定标准核酸序列数据库，其可为细菌核酸测序鉴定方法提供客观、准确的判定依据。

技术领域

本发明涉及DNA测序鉴定技术领域，具体为一种智能DNA条形码的细菌核酸测序鉴定系统及方法。

背景技术

DNA特征序列(DNA条形码)分子鉴定是利用基因组中一段公认的、相对较短的DNA序列来进行物种鉴定的分子生物学分类方法。该方法以核酸测序技术为基础，通过筛选通用DNA特征序列，建立数据库和鉴定平台，运用生物信息学方法分析比对DNA数据，进而对物种进行鉴定，是对传统生物鉴定方法的有效补充和重大突破，近年来受到国内外药品质量标准制定机构的广泛关注，并逐渐成为物种鉴定和分类的研究热点。

DNA条形码技术已发展近20年，鉴别技术、引物设计、扩增条件均较为成熟，鲀毒鱼、高生物胺水产品、有毒蘑菇、曼陀罗等有毒动植物毒性强烈、致死率高，且存在广泛，严重威胁人类健康。鉴定标准数据库的缺乏和分析方法的局限在很大程度上阻碍了食品安全预警、食物中毒溯源、以及污染水平和暴露风险研究。因此，建立地区常见食物中毒源DNA条形码数据库及其快速检测鉴定溯源技术研究已成为当务之急，是保障我国食品安全、指导人们膳食选择、预防中毒事件发生的迫切要求。

发明内容

(一)解决的技术问题

针对现有技术的不足，本发明提供了一种智能DNA条形码的细菌核酸测序鉴定系统及方法，解决了上述背景技术中所提出的问题。

(二)技术方案

为达到以上目的，本发明采取的技术方案是：一种智能DNA条形码的细菌核酸测序鉴定系统，包括提取模块、数据生成模块和数据检测模块，所述提取模块包括细菌核酸提取纯化和细菌核酸测序运作，所述数据生成模块包括细菌核酸DNA的序列生成以及细菌核酸DNA的序列拼接，所述数据检测模块包括细菌DNA序列的数据对比鉴定。

优选的，所述数据对比检测模块包括数据库，所述数据库与数据对比鉴定模块进行双向连接。

优选的，所述数据生成模块在DNA序列数据生成后直接通过数据检测模块进行对比鉴定检测。

一种智能DNA条形码的细菌核酸测序鉴定方法，包括以下步骤：

S1、获取并培养获得需要进行鉴定的细菌菌株；

S2、提取步骤一获得的细菌菌株的基因组DNA；

S3、使用通用核酸测序引物对PCR扩增菌株特定序列；

S4、提取并纯化PCR产物；

S5、测定并生成步骤四得到的PCR产物的核酸序列；

S6、应用序列分析软件进行序列拼接，以通用核酸测序引物对定位，去除引物区，获得相应片段的DNA序列；

S7、将步骤六相应片段的DNA序列与数据库中的资料进行序列对比，对细菌进行鉴定，然后自动生成鉴定结果。

优选的，所述DNA核酸序列在进行序列比对分析时，首先选择具有鉴定和分类意义的核酸序列片段，并根据保守区域核酸序列设计通用核酸测序引物对。