[发明专利]用于鉴定水稻细长粒形的分子标记及其应用

说明书

本发明公开了一种用于鉴定水稻粒形的分子标记，本发明还公开了利用上述分子标记鉴定水稻粒形的方法，包括以下步骤：以需要改良粒形的水稻材料与细长粒sg3杂交后的后代作为待测水稻，提取待测水稻的基因组DNA；利用分子标记对水稻基因组DNA进行PCR扩增；当PCR扩增所得的条带与细长粒sg3的带型一致时，判定其为细长粒形；当PCR扩增所得的条带为与需要改良粒形的水稻材料的带型一致时，判定其为非细长粒形；当PCR扩增所得的条带同时出现需要改良粒形水稻的带型和细长粒sg3的带型时，判定其为携带了两个亲本的调控粒型的等位基因。该方法具有检测准确性高，操作简单，成本低廉的特点。

技术领域

本发明属于基因领域，具体涉及一种改良水稻粒形的分子辅助育种方法。

背景技术

粒形是稻米外观品质的重要组成部分，主要指稻米的粒长、粒宽和粒厚。不同国家、地区消费者对于粒形有各自的喜好，进而决定了水稻的商品价值。同时，粒形也影响着稻米产量。

需要改良的水稻品种为短圆形；不能满足对长粒形有偏好的人群的需求，因此需要对其进行相应粒形改良。

发明内容

本发明要解决的技术问题是提供一种改良水稻粒形的分子辅助育种方法及所用的分子标记。

为了解决上述技术问题，本发明提供一种用于鉴定水稻粒形的分子标记，以水稻作为物种，所述分子标记引物选自下列引物对：

正向引物为：5’-ACGTGTCGCCGTTTAACAAGG-3’；

反向引物为：5’-GGTGGGTTCGGAGGCCATTTG-3’。

本发明还同时提供了利用上述分子标记鉴定水稻粒形的方法，包括以下步骤：

1)、提取待测水稻的基因组DNA；

以需要改良粒形的水稻材料与细长粒sg3杂交后的后代作为待测水稻；

2)、利用分子标记对水稻基因组DNA进行PCR扩增；

3)、当PCR扩增所得的条带与细长粒sg3的带型一致时(即，为aa时)，判定其为细长粒形；

当PCR扩增所得的条带为与需要改良粒形的水稻材料的带型一致时(即，为AA时)，判定其为非细长粒形；

当PCR扩增所得的条带同时出现需要改良粒形水稻的带型和细长粒sg3的带型时(即，为Aa时)，判定其为携带了两个亲本的调控粒型的等位基因，需要在后代分离后进一步PCR扩增，分析带型。

备注说明：sg3的细长粒粒形是隐性遗传，aa为细长粒。

作为本发明的鉴定水稻粒形的方法的改进，步骤2)的PCR扩增反应体系和程序为：

PCR反应体系(10μl)为：DNA模板体积0.5μl，浓度10μM的分子标记的正向引物和反向引物各0.15μl，dNTPs 0.15μl，10×PCR buffer 1μl，Taq酶0.2μl，最后用超纯水定容至10μl；

PCR程序：94℃3min；94℃30sec，55℃30sec、72℃30sec，30个循环；72℃5min；4℃反应停止。

作为本发明的鉴定水稻粒形的方法的进一步改进：所述需要改良粒形的水稻材料为浙农大104。

备注说明：浙农大104籽粒为短圆形。