[发明专利]一种SNP组合及其在桉树无性系鉴定中的应用有效
| 申请号： | 201910180669.6 | 申请日： | 2019-03-11 |
| 公开（公告）号： | CN109706265B | 公开（公告）日： | 2022-04-01 |
| 发明（设计）人： | 李发根;周长品;甘四明;翁启杰;何佳悦 | 申请（专利权）人： | 中国林业科学研究院热带林业研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京高沃律师事务所 11569 | 代理人： | 马小星 |
| 地址： | 510000 广东*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 snp 组合 及其 桉树 无性 鉴定 中的 应用 | ||
1.SNP探针在桉树无性系鉴定中的应用，其特征在于，所述SNP探针的核苷酸序列如SEQID No.1~SEQ ID No.280所示；
所述桉树无性系包括：Guanglin4、Guanglin5、Guang9、DH32-22、DH32-26、T13、EC4、DH32-32、668、EA14-12、EA14-01、EA14-06、DH32-27、DH101-2、DH184-1、DH32-21、DH33-9、k7、DH32-28、DH32-13、DH107-2、GL-WC1、LH88、LH1、Lei7、SH1、Lei11、Lei9、SH49、U7、A13、Q9、Z10-42、9224、U6、Eg6、GL9、Guangzhou1和D29。
2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述应用包括：利用权利要求1所述的SNP探针对桉树无性系的基因型进行分型，根据SNP分型结果利用软件R 3.4.3统计桉树无性系个体间的欧氏遗传距离，建立个体间聚类关系的遗传距离矩阵，按照个体间的遗传距离对桉树无性系进行聚类分析，通过分析个体间遗传距离的远近来鉴定桉树无性系，并构建桉树无性系间的聚类图，实现对桉树无性系的鉴定。
3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，采用软件R3.4.3的R语言程序计算得出桉树无性系个体间的遗传矩阵；
所述R语言程序包括devtools、adegenet、hierfstat、pegas、poppr、ape和ade4。
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