[发明专利]一种马铃薯黄化矮缩病毒RT-LAMP检测引物组及其应用在审
申请号: | 201910187147.9 | 申请日: | 2019-03-13 |
公开(公告)号: | CN109735663A | 公开(公告)日: | 2019-05-10 |
发明(设计)人: | 郑璐平;沈建国;孟若雪;陈峰;姚锦爱 | 申请(专利权)人: | 福建农林大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6844;C12R1/94 |
代理公司: | 福州元创专利商标代理有限公司 35100 | 代理人: | 蔡学俊 |
地址: | 350002 福*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 黄化 马铃薯 病毒 引物组 应用 引物 检测 病毒监测 待测样品 等温条件 复杂仪器 结果检测 内侧引物 现场检测 温育 灵敏 | ||
1.一种马铃薯黄化矮缩病毒RT-LAMP检测引物组,其特征在于,所述引物组由1对外侧引物F3/B3和1对内侧引物FIP/BIP组成,其核苷酸序列如下:
F3: 5’- GAGACAGAGAGTGGCATTGG-3’,
B3: 5’- ATTGCATCCACCGGAGTG-3’,
FIP: 5’- TGGTGCTTCTTCATTGGCACGT-ATGCAGATGGGAGGAGCC-3’,
BIP: 5’- CAGAAGAGAGCCACACCAGCA-GATGCTGTTCCGGATGTCC-3’。
2.一种利用权利要求1所述引物组检测马铃薯黄化矮缩病毒的RT-LAMP检测方法,其特征在于,包括以下具体步骤:
(1)待测样品RNA提取;
(2)RT-LAMP反应体系的建立:25μL体系中含有10×Thermolpol 缓冲液2.5μL、8000U/mL 的Bst聚合酶1μL、10U/μL 的AMV反转录酶1μL、RNA模板2.5 μg、终浓度为1.2 mM的dNTPs、终浓度为6 mM的MgSO4、终浓度为1.6 μM 的内侧引物FIP、终浓度为1.6 μM 的内侧引物BIP、终浓度为0.4 μM的外侧引物F3、终浓度为0.4 μM的外侧引物B3,余量为水;
(3)RT-LAMP反应条件:于实时浊度仪中进行反应,63°C恒温反应60min,80°C灭活5min结束反应;
(4)反应结果的测定:采用荧光染料目测观察法和/或实时浊度法进行测定;
采用荧光染料目测观察法:RT-LAMP反映结束后,在反应产物中加入1μL SYBR GreenI,反应产物为荧光绿色则表示结果为阳性,检测到马铃薯黄化矮缩病毒,反应产物为橙色则表示结果为阴性,未检测到马铃薯黄化矮缩病毒;
实时浊度法:浊度仪根据RT-LAMP扩增过程中生成的焦磷酸镁的沉淀量以数值的形式记录下来,然后根据数据制作成RT-LAMP扩增产物曲线图,以数据和曲线的形式来反映RT-LAMP扩增结果,浊度仪出现扩增曲线,则表示结果为阳性,反之为阴性。
3.如权利要求1所述的马铃薯黄化矮缩病毒RT-LAMP检测引物组在马铃薯黄化矮缩病毒监测、检测和鉴定上的应用。
4.如权利要求2所述的马铃薯黄化矮缩病毒的RT-LAMP检测方法在马铃薯黄化矮缩病毒的监测、检测和鉴定上的应用。
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