[发明专利]基于CRISPR-Cas12a和G四链体-血红素的EBV的检测方法及应用有效
申请号: | 201910191649.9 | 申请日: | 2019-03-14 |
公开(公告)号: | CN109929949B | 公开(公告)日: | 2019-12-31 |
发明(设计)人: | 邓敏;刘万里;邢珊 | 申请(专利权)人: | 广州医科大学附属肿瘤医院 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6844;C12Q1/6806;C12N15/70 |
代理公司: | 44493 广州专理知识产权代理事务所(普通合伙) | 代理人: | 谭昉 |
地址: | 510095 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 孵育 复合物溶液 缓冲液 四链体 血红素 检测 准确度 高敏感性 患者血清 扩增引物 低成本 吸光度 冻干 混匀 酶粉 应用 | ||
1.CRISPR-Cas12a和G四链体-血红素在制备检测EBV的试剂中的用途,其特征在于,所述试剂的制备过程如下:
1)制备RPA产物:以EBV患者血清中提取到的DNA为模板,将含扩增引物对、重泡胀缓冲液、ddH2O的RPA反应体系加入冻干酶粉中,再加入MgAc混匀,孵育,得到RPA产物;
2)制备PS2.M/Hemin溶液:PS2.M DNA溶解在Tris-HCl溶液,向溶液中加入Hemin溶液,制得PS2.M/Hemin溶液;
3)制备Cas12a/crRNA复合物溶液:将FnCas12a和EBV crRNA加入到Tris-HCl缓冲液中,孵育,制得Cas12a/crRNA复合物溶液;
4)检测EBV:将RPA产物、PS2.M/Hemin溶液、Cas12a/crRNA复合物溶液孵育,加入ABTS和H2O2处理后测定吸光度。
2.根据权利要求1所述的CRISPR-Cas12a和G四链体-血红素在制备检测EBV的试剂中的用途,其特征在于,步骤1)中,所述DNA提取采用病毒基因组DNA/RNA提取试剂盒进行提取;
所述扩增引物对包括RPA引物对1、
RPA-1上游引物: 5' CACCTTCATCACCGTCGCTGACTCCGCCATC3',序列如SEQ ID NO.4所示;
RPA-1下游引物: 5' GCGACCGGTGCCTTCTTAGGAGCTGTCCGAG3';序列如SEQ ID NO.5所示;
或RPA引物对2
RPA-2上游引物: 5' ATTTCTGGTCGCATCAGAGCGCCAGGAGTC3',序列如SEQ ID NO.6所示;
RPA-2下游引物:5' GCAAGACGAGGGAGGGAAGGGGAAAAGTTAGA3',序列如SEQ ID NO.7所示;
所述孵育过程如下:37℃水浴锅中孵育20min。
3.根据权利要求1所述的CRISPR-Cas12a和G四链体-血红素在制备检测EBV的试剂中的用途,其特征在于,所述Tris-HCl溶液的浓度为20mmol/L,pH7.5,含100 mmol/L KCl、40mmol/L MgCl2、0.008% Triton X-100;所述Hemin溶液由Hemin用DMSO配制成。
4.根据权利要求1所述的CRISPR-Cas12a和G四链体-血红素在制备检测EBV的试剂中的用途,其特征在于,所述FnCas12a的制备过程如下:使用化学合成法进行FnCas12基因合成,并将FnCas12克隆入PET-32a原核表达载体中;经Sanger法测序鉴定插入序列正确后,将重组质粒转化大肠杆菌E.coli. BL21;用IPTG诱导表达6His-TRX-TCRP1融合蛋白,进行亲和层析纯化融和蛋白;用EK酶切去除融合蛋白6His标签,并纯化鉴定FnCas12蛋白。
5.根据权利要求1所述的CRISPR-Cas12a和G四链体-血红素在制备检测EBV的试剂中的用途,其特征在于,所述EBV crRNA的制备过程如下:合成正义链序列、反义链序列;将二者经退火形成双链DNA;经T7 polymerase体外转录成crRNA,并使用亲和层析纯化得到EBVcrRNA;
所述正义链序列为
5’TAATACGACTCACTATAGGGTAATTTCTACTAAGTGTAGATCTGCTAAGCCCAACACTCCA3’;
所述反义链序列为
5’ TGGAGTGTTGGGCTTAGCAGATCTACACTTAGTAGAAATTACCCTATAGTGAGTCGTATTA 3’;
所述EBV crRNA序列为
5’UAAUUUCUACUAAGUGUAGAUCUGCUAAGCCCAACACUCCA3’。
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