[发明专利]一种检测NTRK融合的FISH探针组及其应用有效
| 申请号： | 201910205579.8 | 申请日： | 2019-03-18 |
| 公开（公告）号： | CN109988836B | 公开（公告）日： | 2022-06-07 |
| 发明（设计）人： | 卢皇彬;林煌艺;朱思琪;郑立谋 | 申请（专利权）人： | 厦门艾德生物技术研究中心有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6886 | 分类号： | C12Q1/6886;C12Q1/6841;C12N15/11 |
| 代理公司： | 厦门市首创君合专利事务所有限公司 35204 | 代理人： | 张松亭;姜谧 |
| 地址： | 361000 福建省厦门市火炬高新*** | 国省代码： | 福建;35 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 检测 ntrk 融合 fish 探针 及其 应用 | ||
1.一种检测NTRK融合的FISH探针组，其特征在于：包括
NTRK1 5′端探针组，以NTRK1基因着丝粒一侧的核苷酸序列的不同的二BAC克隆为模板，用随机引物扩增而得，其中每一探针均修饰有第一荧光报告基团；该NTRK1 5′端探针组的模板由RP11-1054F3和RP11-66D17组成；
NTRK1 3′端探针组，以NTRK1基因端粒一侧的核苷酸序列的不同的二BAC克隆为模板，用随机引物扩增而得，其中每一探针均修饰有第二荧光报告基团；该NTRK1 3′端探针组的模板由RP11-1038N13和RP11-110J1组成；
NTRK2 5′端探针组，以NTRK2基因着丝粒一侧的核苷酸序列的不同的二BAC克隆为模板，用随机引物扩增而得，其中每一探针均修饰有第一荧光报告基团；该NTRK2 5′端探针组的模板由RP11-324L15和CTD-2509D1组成；
NTRK2 3′端探针组，以NTRK2基因端粒一侧的核苷酸序列的不同的二BAC克隆为模板，用随机引物扩增而得，其中每一探针均修饰有第二荧光报告基团；该NTRK2 3′端探针组的模板由RP11-152D13和CTD-2339E11组成；
NTRK3 5′端探针组，以NTRK3基因着丝粒一侧的核苷酸序列的不同的二BAC克隆为模板，用随机引物扩增而得，其中每一探针均修饰有第一荧光报告基团；该NTRK3 5′端探针组的模板由RP11-110O23和RP11-97O12组成；
NTRK3 3′端探针组，以NTRK3基因端粒一侧的核苷酸序列的不同的二BAC克隆为模板，用随机引物扩增而得，其中每一探针均修饰有第二荧光报告基团；该NTRK3 3′端探针组的模板由RP11-113C11和CTD-2526N1组成；
上述随机引物由9个核苷酸构成，每一核苷酸为A、T、C或G，且从5′端起算的第一和/或第五位的核苷酸通过spacer 9连接修饰有荧光基团。
2.一种检测NTRK融合的FISH试剂盒，其特征在于：包括权利要求1所述的FISH探针组。
3.如权利要求2所述的FISH试剂盒，其特征在于：包括
NTRK1基因断裂探针体系，由所述NTRK1 5′端探针组、NTRK1 3′端探针组、Cot-1 DNA、2×杂交液和ddH2O组成；
NTRK2基因断裂探针体系，由所述NTRK2 5′端探针组、NTRK2 3′端探针组、Cot-1 DNA、2×杂交液和ddH2O组成；
NTRK3基因断裂探针体系，由所述NTRK3 5′端探针组、NTRK3 3′端探针组、Cot-1 DNA、2×杂交液和ddH2O组成；
其中，2×杂交液的配方中含有50%（V/V）甲酰胺和10%（W/V）硫酸葡聚糖，并以2×SSC溶液为溶剂。
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