[发明专利]一种烟草NtNHX2基因的克隆及在不同逆境下表达模式的分析方法在审

专利信息
申请号: 201910219876.8 申请日: 2019-03-22
公开(公告)号: CN109913446A 公开(公告)日: 2019-06-21
发明(设计)人: 罗银;卓维;陈倩;李立芹 申请(专利权)人: 罗银
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10;C12N15/29;C12Q1/6895;C12Q1/6851
代理公司: 遵义浩嘉知识产权代理事务所(普通合伙) 52112 代理人: 李雪梅
地址: 563000 贵州省遵义市*** 国省代码: 贵州;52
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摘要:
搜索关键词: 条带 表达模式 烟草 测序 基因 逆境 克隆 琼脂糖凝胶电泳 表达差异分析 基因表达水平 反转录合成 特异性表达 表达水平 功能研究 基因利用 基因序列 目的片段 耐盐机制 内参基因 烟草幼苗 预期目标 总RNA 弥散 低钾 高盐 胁迫 相符 分析 回收 干旱 清晰 重复
【权利要求书】:

1.一种烟草NtNHX2基因的克隆方法,其特征在于,包括以下步骤:

a. 依据GenBank收录的NtNHX2基因序列LOC107808863,用DNAMAN 软件设计出基因克隆引物:正向引物:NtNHX2-F:ATGGCGTCTGAGCTGGC;反向引物NtNHX2-R:TCATGGTTCCTGTTCCGTTG;

b. 利用Trizol试剂提取烟草幼苗总RNA,经cDNA合成试剂盒反转录为cDNA,以cDNA为模板,用引物NtNHX2-F/NtNHX2-R进行PCR扩增;

c. 使用DNA凝胶纯化回收试剂盒将目的片段纯化,将其与pMD19-T载体在16℃条件下连接过夜,连接产物转化大肠杆菌DH5α感受态,然后将感受态细胞加入到含氨苄青霉素(Amp)的LB固体培养基上涂板,37℃过夜倒置培养;

d. 用牙签挑取少量菌落进行PCR检测,筛选出阳性克隆进行测序。

2.根据权利要求1所述烟草NtNHX2基因的克隆方法,其特征在于:对阳性克隆测序结果显示目的片段大小为1605bp。

3.根据权利要求1所述烟草NtNHX2基因的克隆方法,其特征在于:步骤b中所述的扩增反应程序为95℃预变性5min;95℃变性30s,55℃退火30s,72℃延伸1min,34个循环;最后72℃延伸8min。

4.根据权利要求1至3中任意一项所述烟草NtNHX2基因的克隆方法,其特征在于:步骤b中所述的烟草幼苗由烤烟K326种子培育而得。

5.一种如权利要求1所述烟草NtNHX2基因在不同逆境下表达模式的分析方法,其特征在于,包括以下步骤:

①对烟草幼苗进行高盐、低钾处理:挑取长势一致的的烟草幼苗分别进行高盐、低钾处理,每种处理设五个组,各组对应的处理时间依次为0h、3h、6h、12h和24h,以0h处理为对照,每个处理时间分别设置3次生物学重复,进行整株取样冻存;

②对烟草幼苗进行干旱、4℃、ABA处理:挑取长势一致的的烟草幼苗分别进行干旱、4℃、ABA处理,每种处理设五个组,各组对应的处理时间依次为0h、3h、6h、12h和24h,以0h处理为对照,每个处理时间分别设置3次生物学重复,进行整株取样冻存;

③不同非生物逆境胁迫下对烟草NtNHX2基因的表达分析:根据NtNHX2基因序列LOC107808863,采用DNAMAN设计qRT-PCR引物:

正向引物:NtNHX2-qF:CACCGCAGAGGCAGTTAA;

反向引物:NtNHX2-qR:GTTGGCGCAGAAAGTAGC,分别采用经步骤①、步骤②处理所得烟草幼苗的18S rRNA为内参基因进行表达差异分析,基因相对表达量用2-ΔΔCt方法进行计算;3次重复,试验结果以测定的基因相对表达水平平均值表示。

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