[发明专利]利用荧光定量PCR法检测FUT2基因类型的方法在审

专利信息
申请号: 201910222684.2 申请日: 2019-03-22
公开(公告)号: CN110016496A 公开(公告)日: 2019-07-16
发明(设计)人: 李明;罗飞;马博轩 申请(专利权)人: 大连医科大学;合生元(广州)健康产品有限公司
主分类号: C12Q1/6858 分类号: C12Q1/6858;C12Q1/6888
代理公司: 大连东方专利代理有限责任公司 21212 代理人: 李娜;李馨
地址: 116000 辽宁*** 国省代码: 辽宁;21
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摘要:
搜索关键词: 荧光定量PCR 基因类型 非分泌型 分泌型 检测 岩藻糖基转移酶基因 荧光定量PCR检测 分子生物学技术 单核苷酸位点 全血基因组 岩藻糖基化 待测样品 母乳喂养 熔解曲线 乳酸杆菌 双歧杆菌 位置判断 荧光物质 中国人群 低聚糖 多态性 熔解峰 肠道 母乳 丰度 位点 引物 新生儿 突变 基因 预测 分析
【权利要求书】:

1.利用荧光定量PCR法检测FUT2基因类型的方法,其特征在于:所述方法包括下述工艺步骤:

S1,获取待测样品全血基因组DNA;

S2,利用引物及荧光物质进行荧光定量PCR检测,其中,上游引物的序列如SEQ ID NO.1所示;下游引物的序列如SEQ ID NO.2所示:

S3,根据PCR检测后熔解曲线的熔解峰位置判断rs1047781位点的A/T突变情况,进而判断FUT2基因的类型为分泌型或非分泌型。

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述步骤S3中,判断方法如下:熔解峰位置在89.6℃±0.3,则rs1047781位点未发生A/T突变,FUT2基因的类型为分泌型;熔解峰位置在87℃±0.3,则rs1047781位点发生A/T突变,FUT2基因的类型为非分泌型。

3.据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述步骤S2中,PCR反应程序分为4个步骤,具体如下:

①37℃5min,1个循环;

②95℃15min,1个循环;

③95℃15s,55℃20s,72℃20s,40个循环;

④95℃15s,60℃1min,95℃15s,60℃15s,1个循环。

4.据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述待测样品为血液、唾液或乳汁。

5.据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述荧光定量PCR反应体系,具体如下:2倍Premix Ex TaqTMII PCR缓冲液12.5μL;10mol/L上游引物1μL;10mol/L下游引物1μL;终浓度2μM DNA模版2μL;ddH2O 8.5μL,总体积25μL。

6.荧光定量PCR法判断母乳中岩藻糖基化低聚糖含量的方法,所述方法包括下述工艺步骤:

S1,获取母乳全血基因组DNA;

S2,利用引物及荧光物质进行荧光定量PCR检测,其中,上游引物的序列如SEQ ID NO.1所示;下游引物的序列如SEQ ID NO.2所示:

S3,根据PCR检测后熔解曲线的熔解峰位置判断rs1047781位点的A/T突变情况,进而判断FUT2基因的类型为分泌型或非分泌型;

S4,当FUT2基因的类型为非分泌型时,岩藻糖基化低聚糖在该哺乳期母乳中的含量较FUT2基因的类型为分泌型的母乳中岩藻糖基化低聚糖含量低至少50%。

7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于:所述岩藻糖基化低聚糖是以α1-2/3糖苷键连接的岩藻糖基化母乳低聚糖,包括2′-岩藻糖基乳糖(2′LF),3′-唾液酸-3-岩藻糖基乳糖(3′S-3FL),3′-岩藻糖基乳糖(3FL),乳糖二岩藻四糖(LDFT),乳酰-N-岩藻五糖(LNFP),乳糖-N-新双岩藻基六糖(LNnDFH),乳新岩藻五糖(LNnFP)。

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