[发明专利]鉴定小麦产量相关性状的分子标记与方法

权利要求书

1.鉴定或辅助鉴定小麦产量相关性状的方法，所述产量相关性状为穗长和每穗小穗数，所述方法包括：检测待测小麦H和J位点的核苷酸，根据H和J位点的核苷酸确定待测小麦性状：

H位点为T的小麦穗长长于或候选长于H位点为G的小麦穗长；J位点为C的小麦每穗小穗数多于或候选多于J位点为T的小麦每穗小穗数；

所述H位点为序列表序列1自5′末端的第31位，其为T或G；

所述J位点为序列表序列2自5′末端的第21位，其为T或C。

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：所述检测待测小麦H和J位点的核苷酸包括1）和2）：

1）利用名称为PH的引物对对待测小麦的基因组DNA进行PCR扩增，检测PCR扩增产物对应于序列表中序列1的第31位的核苷酸，确定所述H位点的核苷酸；所述PH能扩增得到含有所述H位点的DNA片段；所述PH由名称分别为pe1和pe2的单链DNA组成，所述pe1的序列为序列表中序列3，所述pe2的序列为序列表中序列4；

2）利用名称为PJ的引物对对待测小麦的基因组DNA进行PCR扩增，检测PCR扩增产物对应于序列表中序列2的第21位的核苷酸，确定所述J位点的核苷酸；所述PJ能扩增得到含有所述J位点的DNA片段；所述PJ由名称分别为pe3和pe4的单链DNA组成，所述pe3的序列为序列表中序列5，所述pe4的序列为序列表中序列6。

3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于：检测PCR扩增产物对应于序列表中序列1的第31位的核苷酸通过包括如下a1）或a2）的方法完成：

a1）利用HaeⅢ对所述PH的PCR扩增产物进行酶切，得到酶切产物，检测所述酶切产物的大小，根据所述酶切产物的大小确定PCR扩增产物对应于序列表中序列1的第31位的核苷酸：若所述酶切产物为308 bp的DNA片段，所述PCR扩增产物对应于序列表中序列1的第31位的核苷酸为T，即所述待测小麦在H位点的核苷酸为T；若所述酶切产物为276 bp、32 bp的两个DNA片段，所述PCR扩增产物对应于序列表中序列1的第31位的核苷酸为G，即所述待测小麦在H位点的核苷酸为G；若所述酶切产物为308 bp、276 bp、32 bp的三个DNA片段，所述PCR扩增产物对应于序列表中序列1的第31位的核苷酸为T和G，即所述待测小麦在H位点的核苷酸为T和G；

a2）对所述PH的PCR扩增产物进行测序，若所述PCR扩增产物含有序列表中序列1所示的DNA片段、且不含有序列9所示的DNA片段，所述PCR扩增产物对应于序列表中序列1的第31位的核苷酸为G，即所述待测小麦在H位点的核苷酸为G；若所述PCR扩增产物含有序列表中序列9所示的DNA片段、且不含有序列1所示的DNA片段，所述PCR扩增产物对应于序列表中序列1的第31位的核苷酸为T，即所述待测小麦在H位点的核苷酸为T；若所述PCR扩增产物含有序列表中序列9和序列1所示的两条DNA片段，所述PCR扩增产物对应于序列表中序列1的第31位的核苷酸为T和G，即所述待测小麦在H位点的核苷酸为T和G；

检测所述PJ的PCR扩增产物对应于序列表中序列2的第21位的核苷酸通过包括如下b1）或b2）的方法完成：

b1）利用SalⅠ对所述PJ的PCR扩增产物进行酶切，得到酶切产物，检测所述酶切产物的大小，根据所述酶切产物的大小确定PCR扩增产物对应于序列表中序列2的第21位的核苷酸：若所述酶切产物为216 bp的DNA片段，所述PCR扩增产物对应于序列表中序列2的第21位的核苷酸为T，即所述待测小麦在J位点的核苷酸为T；若所述酶切产物为200 bp、16 bp的两条DNA片段，所述PCR扩增产物对应于序列表中序列2的第21位的核苷酸为C，即所述待测小麦在J位点的核苷酸为C；若所述酶切产物为216 bp、200 bp、16 bp的三条DNA片段，所述PCR扩增产物对应于序列表中序列2的第21位的核苷酸为T和C，即所述待测小麦在J位点的核苷酸为T和C；

b2）对所述PH的PCR扩增产物进行测序，若所述PCR扩增产物含有序列表中序列10所示的DNA片段、且不含有序列11所示的DNA片段，所述PCR扩增产物对应于序列表中序列2的第21位的核苷酸为T，即所述待测小麦在J位点的核苷酸为T；若所述PCR扩增产物含有序列表中序列11所示的DNA片段、且不含有序列10所示的DNA片段，所述PCR扩增产物对应于序列表中序列2的第21位的核苷酸为C，即所述待测小麦在J位点的核苷酸为C；若所述PCR扩增产物含有序列表中序列11和序列10所示的两条DNA片段，所述PCR扩增产物对应于序列表中序列2的第21位的核苷酸为T和C，即所述待测小麦在J位点的核苷酸为T和C。