[发明专利]缺氧相关基因在结直肠癌预测系统中的应用

权利要求书

1.检测缺氧相关基因的表达水平的试剂在制备用于预测II/III期结直肠癌病人预后的试剂盒中的用途，其特征在于，所述试剂用于检测基因TNFAIP8、ORAI3、MINPP1、MBTD1、TRAF3、CYB5R3、ZBTB44、CASP6、DTX3L、FAM117B、PRELID2和IRF1的mRNA表达水平。

2.一种用于预测II/III期结直肠癌病人预后的系统，其特征在于，包括：

数据输入模块，用于将结直肠癌病人的缺氧相关基因的mRNA表达值的结果输入模型计算模块，所述缺氧相关基因包括基因TNFAIP8、ORAI3、MINPP1、MBTD1、TRAF3、CYB5R3、ZBTB44、CASP6、DTX3L、FAM117B、PRELID2和IRF1；所述mRNA表达值为通过Bioconductor的GEOquery程序包标准化处理后的mRNA表达水平数据；

模型计算模块，包括LASSO Cox风险模型，用于根据结直肠癌病人缺氧相关基因的mRNA表达值以及LASSO Cox风险模型计算病人风险分数；所述风险分数的计算公式为：Riskscore=-0.006×exp（TNFAIP8的mRNA表达值）+0.052×exp（ORAI3的mRNA表达值）-0.079×exp（MINPP1的mRNA表达值）-0.023×exp（MBTD1的mRNA表达值）-0.087×exp（TRAF3的mRNA表达值）+0.005×exp（CYB5R3的mRNA表达值）-0.050×exp（ZBTB44的mRNA表达值）-0.019×exp（CASP6的mRNA表达值）-0.003×exp（DTX3L的mRNA表达值）-0.059×exp（FAM117B的mRNA表达值）-0.023×exp（PRELID2的mRNA表达值）-0.070×exp（IRF1的mRNA表达值），高风险组和低风险组的cutoff值-0.083；

结果输出模块，用于根据结直肠癌病人风险分数来预测结直肠癌病人治疗后的预后风险；当结直肠癌病人风险分数≥-0.083时，结直肠癌病人为高风险，生存会显著差，需要更多的临床关注和更好的临床管理；当结直肠癌病人风险分数＜-0.083时，结直肠癌病人为低风险，生存较好，可以用更温和的治疗方案，避免过度治疗。