[发明专利]用于BRAF基因全外显子二代测序的多重PCR引物组合物、试剂及控制系统在审
申请号: | 201910256796.X | 申请日: | 2019-04-01 |
公开(公告)号: | CN111763730A | 公开(公告)日: | 2020-10-13 |
发明(设计)人: | 李慧源;余艳;周鹏涛;彭千;代冰 | 申请(专利权)人: | 长沙金域医学检验实验室有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6869;C12Q1/686;C12N15/11;G16B30/00 |
代理公司: | 湖南中泽专利代理事务所(普通合伙) 43259 | 代理人: | 龙予倩 |
地址: | 410000 湖南省长沙市高*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 braf 基因 全外显子 二代 多重 pcr 引物 组合 试剂 控制系统 | ||
1.一种用于BRAF基因全外显子二代测序的多重PCR引物组合物,其特征在于:包括SEQID NO:01至SEQ ID NO:46所示的引物。
2.一种用于BRAF基因全外显子二代测序的试剂,其特征在于:包括权利要求1所述的用于BRAF基因全外显子二代测序的多重PCR引物组合物及二代测序所需试剂。
3.根据权利要求1或2所述的用于BRAF基因全外显子二代测序的多重PCR引物组合物,其特征在于:
所述多重PCR引物组合物通过如下处理方法获得:
将SEQ ID NO:01~ SEQ ID NO:06、SEQ ID NO:09~ SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:13~ SEQID NO:16、SEQ ID NO:21~ SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:33~ SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:39~SEQ ID NO:40所示的引物记为A类;
SEQ ID NO:07~ SEQ ID NO:08、SEQ ID NO:11~ SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:17~ SEQID NO:20、SEQ ID NO:27~ SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:37~ SEQ ID NO:38、SEQ ID NO:41~SEQ ID NO:46所示的引物记为B类;
将所述A类、所述B类分别混合,分别进行多重PCR扩增处理后,产物加于一管,共同进行凝胶电泳鉴定多重PCR的产物长度可直接用于测序仪后,进行后续实验。
4.一种用于BRAF基因全外显子二代测序的控制系统,其特征在于,包括:
检测模块,采用权利要求2所述的用于BRAF基因全外显子二代测序的试剂进行多重PCR二代测序;
显示模块,将检测结果转换为可视化数据,并将可视化的数据于显示设备进行展示;
分析模块:基于预设的质控程序对检测结果进行验证,并将验证结果于同一显示设备进行展示。
5.根据权利要求4所述的用于BRAF基因全外显子二代测序的控制系统,其特征在于:
运行所述检测模块,包括以下步骤:
步骤一:将全部的引物分为两组,分别震荡混匀备用;
步骤二:两组引物分别进行多重PCR扩增;
步骤三:两组引物共同进行凝胶电泳;
步骤四:文库构件,包括PCR产物纯化、末端修复、接头连接、片段筛选、文库PCR扩增、文库扩增产物纯化;
步骤五:测定DNA产物浓度;
步骤六:将扩增子碱基数*给定的深度,按计算结果将样品混合后稀释到上机浓度;
步骤七:油包水扩增、末班序列富集;
步骤八:置于测序仪进行测序,获得检测结果。
6.根据权利要求5所述的用于BRAF基因全外显子二代测序的控制系统,其特征在于:
所述显示模块将步骤八中的检测结果转化为包括“7号染色体概图”、“测序结果”、“参考序列”三项数据的图表。
7.根据权利要求6所述的用于BRAF基因全外显子二代测序的控制系统,其特征在于:
所述分析模块直接以所述显示模块转化得到的图表为原始数据,与预设的数据进行对比,并向所述显示模块输出检测结果。
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