[发明专利]甲基化标志物及确定个体年龄的方法和应用

权利要求书

1.一种甲基化标志物，其特征在于，选自下列中的至少一种：

chr6:11044867，chr6:11044873，chr6:11044875，chr6:11044877，chr6:11044880,chr6:11044888，chr6:11044894；

任选地，选自chr6:11044867，chr6:11044873，chr6:11044875，chr6:11044877，chr6:11044880,chr6:11044888，chr6:11044894中的至少两种；

任选地，选自chr6:11044867，chr6:11044873，chr6:11044875，chr6:11044877，chr6:11044880,chr6:11044888，chr6:11044894中的至少四种；

任选地，选自chr6:11044867，chr6:11044873，chr6:11044875，chr6:11044877，chr6:11044880,chr6:11044888，chr6:11044894的全部。

2.一种引物对，其特征在于，所述引物对用于特异性扩增权利要求1所述的甲基化标志物；

任选地，所述引物对为SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6或者为SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4。

3.一种探针，所述探针固定在芯片上或者游离于溶液中，其特征在于，所述探针能够特异性识别权利要求1所述的甲基化标志物。

4.一种试剂盒，其特征在于，包括权利要求2所述的引物对和/或权利要求3所述的探针。

5.一种确定生物样品年龄的方法，其特征在于，包括：

测量所述生物样品的基因组DNA中的甲基化标志物的甲基化水平，所述甲基化标志物为权利要求1所述的甲基化标志物；

基于统计预测模型分析确定所述生物样品的年龄。

6.根据权利要求5所述的方法，其特征在于，所述生物样品选自生物个体血液；

任选地，所述测量所述生物样品的基因组DNA中的甲基化标志物的甲基化水平包括：

用亚硫酸氢盐处理来自所述生物样品的基因组DNA，以便将所述甲基化标志物中未甲基化的胞嘧啶转化成尿嘧啶，获得转化产物；

基于所述转化产物构建测序文库、测序，获得所述生物样品的基因组DNA中的甲基化标志物的甲基化水平；

任选地，所述测序为利用测序平台BGISEQ-500对所述测序文库进行高通量测序；

任选地，基于所述转化产物构建测序文库包括：

对所述转换产物进行PCR扩增，获得目的片段；

对所述目的片段进行末端修复，连接接头，获得连接产物；

对所述连接产物进行环化处理，以便获得所述测序文库；

任选地，所述目的片段大小为200-260bp；

任选地，利用引物对SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6或者引物对SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4对所述转化产物进行PCR扩增。

7.根据权利要求5所述的方法，其特征在于，所述统计预测模型选自多元线性回归模型或支持向量机模型中的至少一种；

任选地，所述多元线性回归模型为二元线性回归模型或者四元线性回归模型；

任选地，以所述位点的甲基化率为自变量，以所述年龄为因变量，构建得到所述多元线性回归模型。

8.一种确定个体年龄的方法，其特征在于，包括：

从所述个体收集组织样品；

从所收集的组织样品中提取所述个体的基因组DNA；

测量所述个体的基因组DNA上的甲基化标志物的甲基化水平，所述甲基化标志物为权利要求1所述的甲基化标志物；

基于统计预测模型分析确定所述个体的年龄。