[发明专利]甲基化标志物及确定个体年龄的方法和应用在审
申请号: | 201910262366.9 | 申请日: | 2019-04-02 |
公开(公告)号: | CN111763742A | 公开(公告)日: | 2020-10-13 |
发明(设计)人: | 李生斌;高升杰;李栋;古慧贤;李波 | 申请(专利权)人: | 深圳华大法医科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11;C12M1/00;C12M1/34 |
代理公司: | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人: | 赵天月 |
地址: | 518083 广东省*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 甲基化 标志 确定 个体 年龄 方法 应用 | ||
本发明涉及基因检测领域,具体涉及一种甲基化标志物及确定个体年龄的方法和应用。该甲基化标志物选自:chr6:11044867,chr6:11044873,chr6:11044875,chr6:11044877,chr6:11044880,chr6:11044888,chr6:11044894中的至少一种。该所述确定个体年龄的方法包括:测量所述生物样品的基因组DNA中的上述甲基化标志物的甲基化水平;基于统计预测模型分析确定所述生物样品的年龄。基于本发明提供的甲基化水平预测方法可以快速高效准确的确定个体的年龄。
技术领域
本发明涉及基因检测领域,具体涉及一种通过测量甲基化标志物的甲基化水平确定个体年龄的方法及应用。
背景技术
甲基化是指从活性甲基化合物(如S-腺苷基甲硫氨酸)上将甲基催化转移到其他化合物的过程,是最早发现的基因表观修饰之一,也是表观遗传学的重要研究内容之一。近年来,随着科学家对DNA甲基化的深入研究,发现了DNA甲基化与年龄显著相关。例如,2014年,Renata Zbiec-Piekarska等人对ELOVL2基因上的7个CpG位点,在303份2~75岁的血样中进行建模。拟合的相关系数R为92.7%,预测误差6.85年;2015年,Renata Zbiec-Pi`ekarska等人进一步在相同血样中对ELOVL2、C1orf132、TRIM59、KLF14、FHL2、SLC6A4、F5七个基因的41个甲基化位点进行测序分析,并挑选出五个相关性最高的位点建模,拟合的相关系数R为97.1%,标准差为4.457年。然而与年龄相关的甲基化检测还需要进一步改进。
发明内容
本发明旨在至少在一定程度上解决相关技术中的技术问题之一。为此,本发明的一个目的在于提出一种通过指示年龄的甲基化标志物及通过指示年龄的甲基化标志物的甲基化水平进行年龄鉴定的方法。
本发明的发明人在研究过程中发现:已经报道的与年龄相关的甲基化位点上万种,这些甲基化位点与年龄的相关性不一。本发明的发明人根据人体年龄与人体DNA甲基化的相关性,挑选出与人体年龄相关程度较高的ELOVL2基因上的7个位点,包括:chr6:11044867,chr6:11044873,chr6:11044875,chr6:11044877,chr6:11044880,chr6:11044888,chr6:11044894,这7个位点与个体年龄相关程度较高,利用这些位点作为甲基化标志物,可以用来确认生物样品或者个体的年龄。更进一步地,通过对来自同一个体的不同部位的生物样品的年龄进行鉴定,来反映个体的健康状态。
通过利用软件模拟发现,利用这些位点判断样品的甲基化程度,相比较于其他的位点进行判断,其与样品的甲基化程度的相关性更强,所获得的结果更加可靠。当然,在利用这些位点判断甲基化程度时,可以利用其中的一个位点,也可以利用其中的两个以上的位点。优选利用其中的三个位点、四个位点、五个位点、六个位点以及全部七个位点,来判断个体的甲基化程度,所获得的判定结果更加可靠。组合应用这些位点,可以用来确定生物样品的年龄,用来反映个体的健康状态。
具体而言,本发明提供了如下技术方案:
根据本发明的第一方面,本发明提供了一种甲基化标志物。该甲基化标志物选自下列中的至少一种:chr6:11044867,chr6:11044873,chr6:11044875,chr6:11044877,chr6:11044880,chr6:11044888,chr6:11044894。
在本发明的至少一些实施例中,所述甲基化标志物选自chr6:11044867,chr6:11044873,chr6:11044875,chr6:11044877,chr6:11044880,chr6:11044888,chr6:11044894中的至少两种。
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