[发明专利]一种利用高分辨熔解曲线鉴别五种皮肤癣菌的方法在审
申请号: | 201910298852.6 | 申请日: | 2019-04-15 |
公开(公告)号: | CN110055347A | 公开(公告)日: | 2019-07-26 |
发明(设计)人: | 单小云;徐娟;蔡淑倩;周梦诗;赵飞;龚杰 | 申请(专利权)人: | 金华市中心医院 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/686;C12N15/11;C12R1/645 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 王文君;陈征 |
地址: | 321000 *** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 皮肤癣菌 鉴别 高分辨熔解曲线 特异性引物 食品安全 高分辨熔解曲线分析 絮状表皮癣菌 实时荧光PCR 红色毛癣菌 犬小孢子菌 临床诊断 熔解曲线 灵敏度 环境卫生 可用 癣菌 环境监测 感染 监测 检测 治疗 | ||
1.适用于高分辨熔解曲线鉴别五种皮肤癣菌的特异性引物对,所述五种皮肤癣菌分别为红色毛癣菌(T.rubrum),趾间毛癣菌(T.interdigitale),絮状表皮癣菌(E.floccosum),犬小孢子菌(M.canis)和Microsporum incurvatum,其特征在于,所述特异性引物的核苷酸序列含有如SEQ ID NO.1-2所示的序列或其特异性序列。
2.含有权利要求1所述特异性引物对的试剂盒或检测试剂。
3.权利要求1所述特异性引物对在制备鉴别红色毛癣菌(T.rubrum),趾间毛癣菌(T.interdigitale),絮状表皮癣菌(E.floccosum),犬小孢子菌(M.canis)和Microsporumincurvatum的试剂盒或检测试剂中的应用。
4.权利要求1所述的特异性引物对在保障食品安全或环境卫生监测中的应用。
5.一种鉴别红色毛癣菌(T.rubrum),趾间毛癣菌(T.interdigitale),絮状表皮癣菌(E.floccosum),犬小孢子菌(M.canis)和Microsporum incurvatum的方法,其特征在于,应用权利要求1所述的特异性引物对,以待测样品的DNA为模板,使用Real-time PCR方法进行检测,根据熔解峰值图中熔解曲线的峰形判定结果。
6.如权利要求5所述的方法,其特征在于,Real-time PCR方法中30μL PCR反应体系为:2×Mix Taqman PCR Master 15μL、上下游引物各0.9μL、100×Rox Reference Dye Ⅱ 0.3μL、Evagreen,20×in Water1.5μL、待测DNA模板2μL,用灭菌纯水补足体系至30μL。
7.如权利要求5所述的方法,其特征在于,Real-time PCR反应条件为:预变性:95℃10min;95℃15s,65℃45s,35个循环,升降温速度1.6℃/s。
8.如权利要求5所述的方法,其特征在于,熔解曲线制作条件为:95℃10s,60℃1min,0.025℃/s升温至95℃15s,60℃15s,以1.6℃/s速率升降温,同时连续检测荧光强度;以荧光信号对温度的一阶负导数为纵坐标,温度为横坐标,得到熔解峰值图。
9.如权利要求5-8任一所述的方法,其特征在于,每一种特异性扩增产物Tm值的熔解峰代表一种特定的皮肤癣菌,
其中,Tm值在82-85℃范围内出现熔解峰为红色毛癣菌(T.rubrum)检出;
Tm值在83-85℃范围内出现熔解峰为趾间毛癣菌(T.interdigitale)检出;
Tm值在84-87℃范围内出现熔解峰为絮状表皮癣菌(E.floccosum)检出;
Tm值在88-90℃范围内出现熔解峰为犬小孢子菌(M.canis)检出;
Tm值在86-88℃范围内出现熔解峰为Microsporum incurvatum检出。
10.用于鉴别五种皮肤癣菌的靶序列组合,所述五种皮肤癣菌分别为红色毛癣菌(T.rubrum),趾间毛癣菌(T.interdigitale),絮状表皮癣菌(E.floccosum),犬小孢子菌(M.canis)和Microsporum incurvatum,其特征在于,
用于鉴定红色毛癣菌(T.rubrum)的靶序列含有如SEQ ID NO.3所示的核苷酸序列;
用于鉴定趾间毛癣菌(T.interdigitale)的靶序列含有如SEQ ID NO.4所示的核苷酸序列;
用于鉴定絮状表皮癣菌(E.floccosum)的靶序列含有如SEQ ID NO.5所示的核苷酸序列;
用于鉴定犬小孢子菌(M.canis)的靶序列含有如SEQ ID NO.6所示的核苷酸序列;
用于鉴定Microsporum incurvatum的靶序列含有如SEQ ID NO.7所示的核苷酸序列。
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