[发明专利]鼠种的分子鉴定方法在审
申请号: | 201910311739.7 | 申请日: | 2019-04-18 |
公开(公告)号: | CN109943644A | 公开(公告)日: | 2019-06-28 |
发明(设计)人: | 姚丹丹;姜洪雪;冯志勇 | 申请(专利权)人: | 广东省农业科学院植物保护研究所 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6806 |
代理公司: | 广州市华学知识产权代理有限公司 44245 | 代理人: | 郭炜绵 |
地址: | 510640 *** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 分子鉴定 线粒体细胞色素 核酸序列同源性 特异性引物 形态学鉴定 遗传多样性 基因组DNA 比对结果 反应程序 基因序列 鉴定结果 亲缘关系 通用性强 序列特征 研究生物 重要意义 同源性 氧化酶 测序 扩增 鼠类 网站 检索 进化 验证 基因 应用 分析 | ||
1.一种鼠种分子鉴定方法,其特征在于包括以下步骤:
(1)提取待测鼠种的基因组DNA;
(2)分别应用特异性引物扩增线粒体细胞色素C氧化酶亚基I基因和线粒体细胞色素b基因,然后测序;
(3)将测定序列在NCBI网站上运行Blast核酸序列同源性检索,比对结果中同源性最高的序列为亲缘关系最近的鼠种;
步骤(2)中,用于扩增CO I基因的引物对的序列如下:
正向引物CO I-F:5’-CCTACTCRGCCATTTTACCTATG-3’(SEQ ID NO.1);
反向引物CO I-R:5’-ACTTCTGGGTGTCCAAAGAATCA-3’(SEQ ID NO.2);
用于扩增cyt b基因的引物对的序列如下:
正向引物cyt b-F:5’--CAGCATTTAACTGTGACTAATGAC-3’(SEQ ID NO.3);
反向引物cyt b-R:5’--TACACCTAGGAGGTCTTTAATTG-3’(SEQ ID NO.4)。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:步骤(1)中,用鼠的肝脏、肌肉组织、脚趾或尾巴提取基因组DNA。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:步骤(2)中,用于基因扩增的PCR反应体系为:DNA模板1μl,正反向引物各1μl,Premix Taq 25μl,ddH2O 22μl。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:步骤(2)中,用于基因扩增的PCR反应条件:95℃预变性3~5min,95℃变性30s,52℃~55℃退火30s,72℃延伸40s~1min,32~35个循环,最后再72℃延伸5~10min。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:步骤(2)中,PCR反应结束后以1%琼脂糖凝胶电泳、Goldview核酸染料染色、荧光成像系统检测,PCR产物纯化回收后进行测序。
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