[发明专利]一种利用马来酸全细胞催化合成L-天冬氨酸的菌株与方法在审
申请号: | 201910328535.4 | 申请日: | 2019-04-23 |
公开(公告)号: | CN110004102A | 公开(公告)日: | 2019-07-12 |
发明(设计)人: | 马江锋;储乐乐;方艳;信丰学;董维亮;章文明;陈可泉;姜岷;欧阳平凯 | 申请(专利权)人: | 南京工业大学 |
主分类号: | C12N1/21 | 分类号: | C12N1/21;C12N15/70;C12N15/90;C12N15/54;C12N15/52;C12N15/60;C12N15/61;C12P13/20;C12R1/19 |
代理公司: | 江苏致邦律师事务所 32230 | 代理人: | 徐蓓 |
地址: | 211816 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 马来酸 菌株 全细胞催化 编码基因 天冬氨酸 合成 突变 合成酶编码基因 氨基琥珀酸 基因工程菌 酶编码基因 柠檬酸合酶 天冬氨酸酶 保藏 表达质粒 菌株分类 顺反异构 原料催化 重组质粒 出发菌 构建 敲除 酸酶 催化 生产成本 克隆 基因 转化 | ||
1.一株利用马来酸全细胞催化合成L-天冬氨酸的菌株,其分类命名为Escherichiacoli △fumABC△gltA△argG/pMA,其保藏号为CCTCC NO:M 2019171。
2.权利要求1所述菌株的构建方法,其特征在于,敲除保藏号为CCTCC NO:M 2018521的出发菌株富马酸酶编码基因fumABC、柠檬酸合酶编码基因gltA和精氨基琥珀酸合成酶编码基因argG,同时将天冬氨酸酶编码基因aspA-N217K-T233R-V367G和马来酸顺反异构酶编码基因maiA-G8A-G179A克隆到表达质粒上构成重组质粒,并将其转化至敲除了fumABC、gltA和argG基因的大肠杆菌出发菌株,得到所述基因工程菌,所述fumA基因序列如SEQ ID NO:1所示,所述fumB基因序列如SEQ ID NO:2所示,所述fumC基因序列如SEQ ID NO:3所示,所述aspA基因突变N217K-T233R-V367G后序列如SEQ ID NO:4所示,所述maiA基因序列来源Variibacter gotjawalensis突变G8A-G179A后如SEQ ID NO:5所示,所述gltA基因序列如SEQ ID NO:6所示,所述argG基因序列如SEQ ID NO:7所示。
3.根据权利要求2所述的构建方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)以SEQ ID NO:8和SEQ ID NO:9所示的核苷酸序列为引物,质粒pTarget F为模板,PCR扩增得到线性片段1;
(2)以SEQ ID NO:8和SEQ ID NO:10所示的核苷酸序列为引物,重复步骤(1)得到线性片段2;以SEQ ID NO:8和SEQ ID NO:11所示的核苷酸序列为引物,重复步骤(1)得到线性片段3;以SEQ ID NO:8和SEQ ID NO:12所示的核苷酸序列为引物,重复步骤(1)得到线性片段4;
(3)将线性片段1用SpeI酶切后进行连接,并将连接后产物转化到感受态中,涂布大观霉素的LB平板筛选出阳性重组子;
(4)将阳性重组子接种于添加大观霉素的LB液培扩繁后进行质粒抽提,获得pTargetT1-1质粒;
(5)将线性片段2用SpeI酶切后进行连接转化筛选出阳性重组子进行质粒抽提,获得pTarget T1-2质粒;将线性片段3用SpeI酶切后进行连接转化筛选出阳性重组子进行质粒抽提,获得pTarget T1-3质粒;将线性片段4用SpeI酶切后进行连接转化筛选出阳性重组子进行质粒抽提,获得pTarget T1-4质粒;
(6)以SEQ ID NO:13和SEQ ID NO:14所示的核苷酸序列为引物,大肠杆菌基因组为模板,PCR扩增得到线性片段5;以SEQ ID NO:15和SEQ ID NO:16所示的核苷酸序列为引物,大肠杆菌基因组为模板,PCR扩增得到线性片段6;
(7)以SEQ ID NO:13和SEQ ID NO:16所示的核苷酸序列为引物,片段5和片段6的混合物为模板,重叠PCR扩增得到线性片段7;
(8)将pTarget T1-1质粒用EcoRI线性化后去磷酸化作为载体,与片段7进行吉布森一步克隆,用大观霉素的LB平板筛选出阳性重组子;
(9)将步骤(8)中的阳性重组子接种于添加大观霉素的LB液培扩繁后进行质粒抽提,获得pTarget T2-1质粒;
(10)以SEQ ID NO:17~SEQ ID NO:20所示的核苷酸序列为引物重复步骤(6)至步骤(9)获得pTarget T2-2质粒;以SEQ ID NO:21~SEQ ID NO:24所示的核苷酸序列为引物重复步骤(6)至步骤(9)获得pTarget T2-3质粒;以SEQ ID NO:25~SEQ ID NO:28所示的核苷酸序列为引物重复步骤(6)至步骤(9)获得pTarget T2-4质粒;
(11)将pCas质粒导入保藏号为CCTCC NO:M 2018521的出发菌株中,用卡那霉素的LB平板筛选出阳性重组子;
(12)将步骤(11)中的阳性重组子用阿拉伯糖诱导,制备为感受态;
(13)将pTarget T2-1质粒导入步骤(12)的感受态中,用添加大观霉素和卡那霉素的LB平板筛选出阳性重组子;
(14)将步骤(13)中的阳性重组子用PCR的方法进行鉴定,筛选出目标菌株,并使用IPTG诱导消除pTarget T2-1质粒,获得菌株1;
(15)将步骤(14)中的菌株1用阿拉伯糖诱导,制备为感受态;
(16)将pTarget T2-2质粒导入步骤(15)的感受态中,用添加大观霉素和卡那霉素的LB平板筛选出阳性重组子;
(17)将步骤(16)中的阳性重组子用PCR的方法进行鉴定,筛选出目标菌株,并使用IPTG诱导消除pTarget T2-2质粒,获得菌株2;
(18)用步骤(15)至步骤(17)的方法分批导入pTarget T2-3质粒、pTarget T2-4质粒进行基因敲除,并使用IPTG诱导消除导入质粒,获得基因敲除菌株Escherichia coli△fumABC△gltA△argG;
(19)以SEQ ID NO:29~SEQ ID NO:32所示的核苷酸序列为引物,pGEMT-maiA质粒为模板,PCR扩增得到线性片段8;以SEQ ID NO:33~SEQ ID NO:38所示的核苷酸序列为引物,pGEMT-aspA质粒为模板,PCR扩增得到线性片段9;用DpnI消化后转化大肠杆菌,获得pGEMT-maiA-G8A-G179A和pGEMT-aspA-N217K-T233R-V367G;
(20)以SEQ ID NO:39和SEQ ID NO:40所示的核苷酸序列为引物,pGEMT-maiA-G8A-G179A为模板,PCR扩增得到线性片段10;以SEQ ID NO:41和SEQ ID NO:42所示的核苷酸序列为引物,pGEMT-aspA-N217K-T233R-V367G模板,PCR扩增得到线性片段11;
(21)以SEQ ID NO:39和SEQ ID NO:42所示的核苷酸序列为引物,片段10和片段11的混合物为模板,重叠PCR扩增得到线性片段12;
(22)将pTrc99a质粒用EcoRI和HindIII线性化后去磷酸化作为载体,与片段12进行吉布森一步克隆,用含氨苄抗性的LB平板筛选出阳性重组子;
(23)将步骤(22)中的阳性重组子接种于添加大观霉素的LB液培扩繁后进行质粒抽提,获得pTrc99A-maiAmut-aspAmut质粒;
(24)将步骤(18)中的Escherichia coli△fumABC△gltA△argG制备为感受态;将步骤(23)中的pTrc99A-maiAmut-aspAmut质粒转化至感受态中,用含氨苄抗性的LB平板筛选出阳性重组子,获得目的基因工程菌株。
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