[发明专利]一种降低文库冗余度的膜系统表达文库及其构建方法和应用在审
申请号: | 201910333128.2 | 申请日: | 2019-04-24 |
公开(公告)号: | CN110396515A | 公开(公告)日: | 2019-11-01 |
发明(设计)人: | 王树伟;肖云平;赵仕兰 | 申请(专利权)人: | 上海欧易生物医学科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C40B50/06 |
代理公司: | 上海麦其知识产权代理事务所(普通合伙) 31257 | 代理人: | 董红曼 |
地址: | 201114 上海市闵行*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 表达文库 膜蛋白 构建 膜系统 冗余度 次级文库 酵母文库 载体质粒 文库 应用 可溶性蛋白 冗余序列 反转录 总RNA 蛋白 筛选 研究 | ||
1.一种膜系统表达文库的构建方法,其特征在于,所述构建方法包括以下步骤:
(1)分离mRNA;
(2)反转录及二链合成;
(3)cDNA连接接头;
(4)连接接头的cDNA进行分级分离;
(5)将步骤(4)获得的cDNA与pDONR222质粒进行BP重组,重组后电激转化入大肠杆菌DH10B感受态细菌,经培养得到初级文库;
(6)检测所述初级文库;
(7)制备初级文库质粒:培养经步骤(6)检测合格的初级文库,抽提质粒即得到初级文库质粒;
(8)将步骤(7)得到的初级文库质粒与载体pSPR3na进行LR Clonase II重组酶重组,得到最终次级文库,即所述膜系统表达文库;
其中,所述载体pSPR3na的构建步骤为:在pPR3-N载体的多克隆位点连接入包含attr重组序列和ccDB致死基因在内的序列所生成的质粒;
其中,所述包含attr重组序列和ccDB致死基因在内的序列包含CAACTTTGTACAAAAAAGCTGAAC和GTTCAGCTTTCTTGTACAAAGTTGG两段attr重组序列、以及一段ccDB致死基因序列,其中所述两段attr重组序列连接在所述ccDB致死基因序列的两端。
2.如权利要求1所述的构建方法,其特征在于,所述步骤(1)中,采用Oligotex mRNAMidi Kit方法从100-500微克总RNA中分离mRNA;所述步骤(2)中,用于反转录的mRNA的量为1-5微克。
3.如权利要求1所述的构建方法,其特征在于,所述步骤(2)中,使用biotin-attB2-Oligo(dT)Primer进行反转录获得cDNA。
4.如权利要求1所述的构建方法,其特征在于,所述步骤(3)中,所述接头为attB1Adapter F和R。
5.如权利要求1所述的构建方法,其特征在于,所述步骤(7)中,步骤(6)检测合格的文库cDNA50-200纳克与pDONR222质粒150-600纳克,加入BPII enzyme mix 20-100U进行重组,重组后电激转化入大肠杆菌DH10B感受态细菌,加入SOC培养基1-4毫升培养0.5-3小时后,得到初级文库。
6.如权利要求1~5之任一项所述的构建方法所制备的膜系统表达文库。
7.一种载体pSPR3na,其特征在于,所述载体是在pPR3-N载体的多克隆位点插入包含attr重组序列和ccDB致死基因序列在内的序列所生成的质粒;其中,所述包含attr重组序列和ccDB致死基因在内的序列包含CAACTTTGTACAAAAAAGCTGAAC和GTTCAGCTTTCTTGTACAAAGTTGG两段attr重组序列、以及一段ccDB致死基因序列,其中所述两段attr重组序列连接在所述ccDB致死基因序列的两端。
8.一种载体pSPR3na的构建方法,其特征在于,所述构建方法的步骤为:在pPR3-N载体的多克隆位点连接入包含attr重组序列和ccDB致死基因在内的一段序列所生成的质粒;其中,所述包含attr重组序列和ccDB致死基因在内的序列包含CAACTTTGTACAAAAAAGCTGAAC和GTTCAGCTTTCTTGTACAAAGTTGG两段attr重组序列、以及一段ccDB致死基因序列,其中所述两段attr重组序列连接在所述ccDB致死基因序列的两端。
9.一种如权利要求1~5之任一项所述的构建方法、或如权利要求6所述的膜系统表达文库、或如权利要求7所述的载体pSPR3na进行膜蛋白-膜蛋白、膜蛋白-可溶性蛋白间的互作研究,用于表达文库的筛选,用于两个已知蛋白间互作关系的研究中的应用。
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