[发明专利]黄牛PLAG1基因CNV分子标记的方法及其应用

权利要求书

1.检测黄牛PLAG1基因拷贝数变异的方法在黄牛分子标记辅助选择育种中的应用，其特征在于：所述检测黄牛PLAG1基因拷贝数变异的方法，包括以下步骤：

以待测黄牛基因组DNA为模板，通过实时荧光定量PCR分别扩增PLAG1基因的拷贝数变异区域以及作为内参的BTF3基因的部分片段，然后根据定量结果鉴定黄牛PLAG1基因的拷贝数变异类型；所述的PLAG1基因的拷贝数变异区域位于PLAG1基因参考基因组序列AC_000171.1的37024位至38623位；

所述的PLAG1基因的拷贝数变异区域的扩增引物对为：

上游引物F1：5’- TGTGTATGCAAAGTCGCCCT-3’

下游引物R1：5’- CTTCAGAATCCCTGCCCAGT-3’；

所述的BTF3基因的部分片段的扩增引物对为：

上游引物F2：5’- AACCAGGAGAAACTCGCCAA -3’

下游引物R2：5’- TTCGGTGAAATGCCCTCTCG -3’；

所述的拷贝数变异类型是根据-ΔΔCt将定量结果分为的两类：多拷贝型，-ΔΔCt0.5；正常型，-0.5≤ -ΔΔCt ≤0.5；

具有正常型拷贝数变异类型的柴达木黄牛个体在生长性状管围上优于具有多拷贝型拷贝数变异类型的个体；具有正常型拷贝数变异类型的夏南牛个体在生长性状十字部高上优于具有多拷贝型拷贝数变异类型的个体。

2.如权利要求1所述的应用，其特征在于：所述的实时荧光定量PCR的反应程序为：95℃预变性30~60 s；95℃变性10 s，60℃退火30 s，共40个循环。