[发明专利]一套用于获取馆藏甲虫标本DNA条形码的Mini-Barcoding引物及其应用有效
申请号: | 201910356710.0 | 申请日: | 2019-04-29 |
公开(公告)号: | CN110331210B | 公开(公告)日: | 2022-08-02 |
发明(设计)人: | 陈晓胜;黄卫东;梁馨月;王晓双;王兴民;邱宝利;吴建辉 | 申请(专利权)人: | 华南农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6809;C12N15/11 |
代理公司: | 广州粤高专利商标代理有限公司 44102 | 代理人: | 林丽明 |
地址: | 510642 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一套 用于 获取 馆藏 甲虫 标本 dna 条形码 mini barcoding 引物 及其 应用 | ||
1.一套用于获取馆藏甲虫标本DNA条形码序列的Mini-Barcoding引物组,其特征在于,所述引物组为巢氏PCR引物组,由引物对Cocc658、Cocc301和Cocc413组成;其中,引物对Cocc658为第一轮巢氏PCR引物,其核苷酸序列分别如SEQ ID NO.9~10所示;引物对Cocc301和Cocc413为第二轮巢氏PCR引物,引物对Cocc301的核苷酸序列分别如SEQ IDNO.1~2所示,引物对Cocc413的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.7~8所示。
2.权利要求1所述的Mini-Barcoding引物组在甲虫鉴定、分类中的应用。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,是在馆藏甲虫标本鉴定中的应用。
4.一套获取馆藏甲虫标本DNA条形码序列的方法,其特征在于,包括如下步骤:
S1.提取待测甲虫标本的基因组DNA;
S2.以步骤S1所述基因组DNA为模板,用权利要求1中所述的巢氏PCR引物组进行巢式PCR扩增反应;其中,第一轮扩增使用引物对Cocc658,然后将PCR产物稀释10倍作为第二轮PCR的模板,分别用引物对Cocc301和Cocc413扩增得到甲虫标本两段目的基因片段,然后拼接得到完整的馆藏甲虫标本DNA条形码序列。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述巢式PCR的反应体系均为25 µL体系:无菌水10 µL,PCR Super Mix 12 µL,10 µmol/L上下游引物各1 µL,DNA模板1 µL。
6.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述巢式PCR的反应程序均为94℃预变性3min;94℃变性30 s,50℃退火30 s,72℃延伸1 min,35个循环;72℃最终延伸5 min。
7.权利要求1所述的Mini-Barcoding引物组在制备馆藏甲虫标本鉴定产品中的应用。
8.一套用于鉴定馆藏甲虫标本的产品,其特征在于,包含权利要求1所述的Mini-Barcoding引物组。
9.根据权利要求8所述的产品,其特征在于,还包含用于巢式PCR的反应试剂。
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