[发明专利]一种香蕉枯萎菌4号生理小种AGO基因缺失突变体及其小RNA有效
申请号: | 201910362416.0 | 申请日: | 2019-04-30 |
公开(公告)号: | CN110016520B | 公开(公告)日: | 2020-01-03 |
发明(设计)人: | 张欣;曾凡云;彭军;漆艳香;谢培兰;谢艺贤 | 申请(专利权)人: | 中国热带农业科学院环境与植物保护研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/04;C12N15/113;C12R1/645 |
代理公司: | 44202 广州三环专利商标代理有限公司 | 代理人: | 陈欢 |
地址: | 571101 *** | 国省代码: | 海南;46 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 突变体 小RNA 基因缺失突变体 枯萎菌 致病力 香蕉 非生物胁迫 缺失突变体 香蕉枯萎病 荧光增白剂 技术支撑 致病机制 生长 测序 构建 同源 解析 置换 测试 敏感 分析 开发 | ||
1.一种香蕉枯萎菌4号生理小种AGO基因缺失突变体,其特征在于,所述香蕉枯萎菌4号生理小种AGO基因缺失突变体为以下3种香蕉枯萎菌4号生理小种AGO基因缺失突变体中的任意一种:Δago1突变体、Δago2突变体和Δago1/2突变体;
所述Δago1突变体、Δago2突变体和Δago1/2突变体通过以下方法获得:
1)构建Foc4 AGO1基因缺失重组DNA片段,采用潮霉素抗性基因HPH替换AGO1基因,原生质体转化,获得Foc4 AGO1基因缺失突变体,即Δago1突变体;采用相同的方法敲除AGO2基因,构建Δago2突变体;
2)在Δago1突变体的基础上构建Foc4 AGO1/2双基因缺失重组DNA片段,采用新霉素NEO抗性基因替换AGO2基因,原生质体转化,获得Foc4 AGO1/2双基因缺失突变体,即Δago1/2突变体。
2.根据权利要求1所述的香蕉枯萎菌4号生理小种AGO基因缺失突变体,其特征在于,步骤1)Δago1突变体的构建方法为:
第一轮PCR扩增:
左端LB:以FOC4基因组DNA为模板,Foc4AGO1-LBCK和Foc4AGO1-HPH-LB-R为引物,扩增产物大小1993bp;
右端RB:以FOC4基因组DNA为模板,Foc4AGO1-HPH-RB-F和Foc4AGO1-RBCK为引物,扩增产物大小1988bp;
潮霉素抗性基因HPH:载体质粒DNA为模板,HYG-F和HYG-R为引物,扩增产物大小1376bp;
第二轮PCR扩增:
左端LB+HP:左端LB和潮霉素抗性基因HPH为模板,Foc4AGO1-LB-F和HYG-R1为引物,扩增产物大小2415bp;
右端PH+RB:右端RB和潮霉素抗性基因HPH为模板,HYG-F1和FOC4AGO1-RB-R为引物,扩增产物大小2274bp;
将第二轮PCR片段回收后导入原生质体进行转化,获得Foc4 AGO1基因缺失突变体,即Δago1突变体;
其中,Foc4AGO1-LBCK、Foc4AGO1-HPH-LB-R、Foc4AGO1-HPH-RB-F、Foc4AGO1-RBCK、Foc4AGO1-LB-F、HYG-R1、HYG-F1和Foc4AGO1-RB-R的序列依序如SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4和SEQ ID NO:11所示。
3.根据权利要求1所述的香蕉枯萎菌4号生理小种AGO基因缺失突变体,其特征在于,步骤1)Δago2突变体的构建方法为:
第一轮PCR扩增:
左端LB:FOC4基因组DNA为模板,Foc4 AGO2-LBCK和Foc4AGO2-HPH-LB-R为引物,扩增产物大小1840bp;
右端RB:FOC4基因组DNA为模板,Foc4AGO2-HPH-RB-F和Foc4AGO2-RBCK为引物,扩增产物大小1900bp;
潮霉素抗性基因HPH:载体质粒DNA为模板,HYG-F和HYG-R为引物,扩增产物大小1376bp;
第二轮PCR扩增:
左端LB+HP:左端LB和潮霉素抗性基因HPH为模板,Foc4AGO2-LB-F和HYG-R1为引物,扩增产物大小2411bp;
右端PH+RB:右端RB和潮霉素抗性基因HPH为模板,HYG-F1和Foc4AGO2-RB-R为引物,扩增产物大小2134bp;
其中,Foc4 AGO2-LBCK、Foc4AGO2-HPH-LB-R、Foc4AGO2-HPH-RB-F、Foc4AGO2-RBCK、Foc4AGO2-LB-F、HYG-R1、HYG-F1和Foc4AGO2-RB-R的序列依序如SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4和SEQ ID NO:17所示。
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