[发明专利]用于检测ANRSV的RT-LAMP检测引物及其应用、检测试剂和检测方法有效
申请号: | 201910387290.2 | 申请日: | 2019-05-10 |
公开(公告)号: | CN110184386B | 公开(公告)日: | 2022-12-09 |
发明(设计)人: | 庹德财;沈文涛;赵光远;周鹏;言普;黎小瑛 | 申请(专利权)人: | 中国热带农业科学院热带生物技术研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6844;C12N15/11;C12R1/94 |
代理公司: | 北京集佳知识产权代理有限公司 11227 | 代理人: | 潘颖;赵青朵 |
地址: | 571101 *** | 国省代码: | 海南;46 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 anrsv rt lamp 引物 及其 应用 试剂 方法 | ||
1.RT-LAMP检测引物,其特征在于,所述引物的序列如下:
外引物ANRSV-F3:序列如SEQ ID NO:1所示;
外引物ANRSV-B3:序列如SEQ ID NO:2所示;
内引物ANRSV-FIP:序列如SEQ ID NO:3所示;
内引物ANRSV-BIP:序列如SEQ ID NO:4所示。
2.如权利要求1所述RT-LAMP检测引物在制备槟榔坏死环斑病毒检测试剂中的应用。
3.一种槟榔坏死环斑病毒的RT-LAMP检测试剂,其特征在于,包括权利要求1所述RT-LAMP检测引物。
4.根据权利要求3所述的RT-LAMP检测试剂,其特征在于,还包括dNTP、缓冲液、Bst DNA聚合酶、核酸染料、MgSO4及水。
5.根据权利要求4所述的RT-LAMP检测试剂,其特征在于,还包括甜菜碱、AMV逆转录酶。
6.一种槟榔坏死环斑病毒的RT-LAMP检测方法,其特征在于,采用权利要求3至5中任一项所述RT-LAMP检测引物对槟榔坏死环斑病毒的RNA进行扩增。
7.根据权利要求6所述的RT-LAMP检测方法,其特征在于,模板是RNA时,所述RT-LAMP检测方法的反应体系如下:
dNTP 1~3mM;
10×缓冲液 2.5μL;
甜菜碱 0~1.5M;
MgSO4 0~10mM;
ANRSV-FIP 3~7μmol;
ANRSV-BIP 3~7μmol;
ANRSV-F3 20~60μmol;
ANRSV-B3 20~60μmol;
AMV逆转录酶 1~8U;
Bst DNA聚合酶 2~20U;
模板RNA 1pg;
用水补足25μL;
其中,甜菜碱和MgSO4均不为0;
模板是cDNA或质粒时,所述RT-LAMP检测方法的反应体系如下:
dNTP 1~3mM;
10×缓冲液 2.5μL;
甜菜碱 0~1.5M;
MgSO4 0~10mM;
ANRSV-FIP 3~7μmol;
ANRSV-BIP 3~7μmol;
ANRSV-F3 20~60μmol;
ANRSV-B3 20~60μmol;
Bst DNA聚合酶 2~20U;
模板cDNA或质粒 1pg;
用水补足25μL;
其中,甜菜碱和MgSO4均不为0。
8.根据权利要求7所述的RT-LAMP检测方法,其特征在于,还包括向扩增得到的反应产物中加入核酸染料,所述核酸染料在反应产物中的加入量为0.01μL/μL。
9.根据权利要求7所述的RT-LAMP检测方法,其特征在于,所述RT-LAMP的反应温度为57~65℃,反应时间为30~60min;
还包括向扩增得到的反应产物中加入核酸染料,所述核酸染料为10000×SYBR GreenI。
10.根据权利要求9所述的RT-LAMP检测方法,其特征在于,所述RT-LAMP检测方法的判断方法为:
反应液颜色为橙色,表示结果为阴性,待测样品中不含槟榔坏死环斑病毒;
反应液颜色为绿色,表示结果为阳性,待测样品中含有槟榔坏死环斑病毒。
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