[发明专利]一种基因治疗安全评估与毒副作用预防的方法在审

专利信息
申请号: 201910388932.0 申请日: 2019-05-10
公开(公告)号: CN111909986A 公开(公告)日: 2020-11-10
发明(设计)人: 潘雨堃 申请(专利权)人: 潘雨堃
主分类号: C12Q1/6848 分类号: C12Q1/6848;C12Q1/6869
代理公司: 上海精晟知识产权代理有限公司 31253 代理人: 冯子玲
地址: 201100 上海*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 基因治疗 安全 评估 副作用 预防 方法
【权利要求书】:

1.一种基因治疗安全评估的方法,其特征在于,包括:

步骤一:提取携带整合型基因治疗载体的靶细胞的基因组,酶切获得DNA片段并在两端连接加上Splinkerette接头寡核苷酸,多聚酶链式反应扩增整合型载体插入位点旁基因组序列,随后通过巢式PCR进一步扩增插入位点旁的基因组序列并在引物中加入接头序列;

步骤二:高通量测序获得整合型载体随机插入位点旁的基因组序列信息,定位整合型基因治疗载体在靶细胞中的插入位点,判断有无插入位点位于原癌基因附近并激活原癌基因的可能。

2.如权利要求1所述的基因治疗安全评估的方法,其特征在于:

步骤一中,酶切使用Sau3AI酶。

3.如权利要求1所述的基因治疗安全评估的方法,其特征在于:

步骤一中,通过巢式PCR进一步扩增插入位点旁的基因组序列并在引物中加入illumina接头序列。

4.一种规避基因治疗毒副作用的预防方法,其特征在于,包括:

步骤一:将iCaspase9基因与治疗基因串联在同一DNA分子内并通过2A肽连接,装入整合型基因治疗载体内,从而使得转录得到的单一信使RNA可以同时过表达iCaspase9基因与治疗基因,

步骤二:在相关安全风险存在时为规避毒副作用,加入AP1903药物激活自杀基因,清除癌变的靶细胞。

5.如权利要求4所述的规避基因治疗毒副作用的预防方法,其特征在于:

步骤一中,包括步骤1-1:使用引物EcoiCasF,序列见SEQ ID No:1和2AiCasR,序列见SEQ ID No:2,以pMSCV-F-del Casp9.IRES.GFP质粒为模板,PCR扩增可诱导性自杀基因iCaspase9编码基因;使用引物2AlucF,序列见SEQ ID No:12和EcolucR,序列见SEQ ID No:13,以pGL3-Basic质粒为模板,PCR扩增荧光素酶Luc编码基因;使用引物EcoiCasF序列见SEQ ID No:1,和EcolucR序列见SEQ ID No:13,以iCaspase9和luciferase片段为模板,重叠延伸PCR扩增获得iCaspase-2A-Luc编码基因;然后,酶切装入pCAG-EGFP质粒的两个EcoRI位点间。

6.如权利要求5所述的规避基因治疗毒副作用的预防方法,其特征在于:

步骤一中,还包括步骤1-2:鸡β-肌动蛋白复合启动子CAG、iCaspase-2A-luc编码序列和兔β-球蛋白polyA由SalI和HindIII酶切,末端补平后,装入缺陷piggyBac转座子中的PmeI位点内。

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