[发明专利]一种高通量检测8种疫霉菌的分子检测方法有效

专利信息
申请号: 201910391877.0 申请日: 2019-05-10
公开(公告)号: CN110079631B 公开(公告)日: 2022-11-15
发明(设计)人: 戴婷婷;焦彬彬;郑小波 申请(专利权)人: 南京林业大学
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/6844;C12Q1/04;C12R1/645
代理公司: 南京申云知识产权代理事务所(普通合伙) 32274 代理人: 邱兴天
地址: 210037 江*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 通量 检测 霉菌 分子 方法
【权利要求书】:

1.一种高通量检测8种疫霉菌的分子检测方法,其特征在于:包括提取待检微生物的DNA,以提取的DNA为模板,利用8种疫霉菌 LAMP检测引物与96孔板相结合对待检微生物同时进行高通量检测;观察LAMP反应溶液颜色变化,天蓝色表示检测结果为阳性,存在目标疫霉菌;紫色表示检测结果为阴性,不存在目标疫霉菌;所述8种疫霉菌LAMP检测引物包括Phytophthora parasiticaPhytophthora tentaculataPhytophthora infestansPhytophthora fragariaePhytophthora capsiciPhytophthora drechsleriPhytophthora cactorumPhytophthora megasperma的LAMP检测引物,每种疫霉菌的LAMP检测引物由正向内引物FIP、反向内引物BIP、正向外引物F3、反向外引物B3和正向环引物LF、反向环引物LB组成,各引物序列具体如下:

Phytophthora parasitica的引物包括:

F3:5'-CTTTGTAAGTGCCACCATAC-3';

B3:5'-ACAGACACACACGTGATT-3';

FIP:5'-TCGATCGTACGGATTTTCTGCAGAAAGATCCAGGTTTTCATCAGG-3';

BIP:5'-AGACCATCAAGCTCCAGATTGTACGTGGTACATCGGTTAGTTGAA-3';

LB:5'-GACTTGTATCACTGCAGTTT-3';

Phytophthora tentaculata的引物包括:

F3:5'-TGCCTTATAGGAATAGCGC-3';

B3:5'-AGCATAAGTGAATTGACCCA-3';

FIP:5'-ATCGTACGGATTTTCTGAGCAAAGTAGATCCCGATTTCCATCAG-3';

BIP:5'-TGGACGGCAAGACCATCAAGTCCGTTAGTTAAATAAATACCTCGA-3';

LB:5'-CTCCAGATTGTACGTCCTTCGT-3';

Phytophthora infestans的引物包括:

F3:5'-TGTGAGTGTCTAACATATTTTACG-3';

B3:5'-GTTAGTTAAATAGGAAATCACGC-3';

FIP:5'-AATCGCGAAAGCCATGTGAGCCAAACGACCTTTTGTAAGG-3';

BIP:5'-TTGCTTAGAAAATCCGTACGATCGGACAAATGTTTTTTTAGCGGC-3';

LB:5'-GGCAAGACCATCAAGCTCCAA-3';

Phytophthora fragariae的引物包括:

F3:5'-TGAGTGCTAGTAACTAGCCT-3';

B3:5'-ACCAGTTAGCTCCATGAAGC-3';

FIP:5'-CTGTGCACAACAACGAGCACGAATTCCTAGGTCCAAAAAGGC-3';

BIP:5'-AATTCGCACGATCGAGCTGGATTAGCCGGCGAAATGTTCC-3';

LF:5'-CAGCAATCGGAGAGCAAATCTTA-3';

LB:5'-CGGCAAGACTATCAAGCTCCAGA-3';

Phytophthora capsici的引物包括:

F3:5'-CTCTGTTGTATAGCAGAGGT-3';

B3:5'-GCACAAGACAATTAGCACAAT-3';

FIP:5'-TTCTGGGCGCGTACACAAACTTAGTGAGGGACAATTTATATCAGG-3';

BIP:5'-GATCGAGTTGGACGGCAAGATCCAGTGCTCTAACTAAAACG-3';

LB:5'-CCATCAAGCTCCAGATTGTAAGC-3';

Phytophthora drechsleri的引物包括:

F3:5'-GTGATCCTTTCACCCTGG-3';

B3:5'-TTACAAATGTCAGCTGGATG-3';

FIP:5'-CGGATTTTCTAGAACGTGGTACCAAAATGAAGAGTCGACTCTAGCA-3';

BIP:5'-ACTATTGAGCTGGACGGCAATCGATAGCAGCCCAAGAG-3';

LB:5'-TGTACGTCTACAGAGGATTTGGAT-3';

Phytophthora cactorum的引物包括:

F3:5'-TTCTGCGCTAGGCGACC-3';

B3:5'-CACACAAGTGGACCGTTAG-3';

FIP:5'-TCTGGGCACAACCGCAAAAATTTGCGAGCTCCAGATTTCC-3';

BIP:5'-AATCCGTACGATCGAGCTGGACACACGCCACGTCTGCT-3';

LB:5'-GGAAAGACCATCAAGCTCCAGAT-3';

Phytophthora megasperma的引物包括:

F3:5'-GCTCTGCTCTTCCGACTTG-3';

B3:5'-GTTAGTTTCGTCCACGGCA-3';

FIP:5'-CGGGCAAGAGCAACGTCAGTGTCCCATTGTGGTCCAGTAC-3';

BIP:5'-TCCGTACGATCGAGCTGGACGAGAAGAAAGGAATGGAGGCC-3';

LB:5'-GCAAGACCATCAAGCTCCAGATTG-3'。

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