[发明专利]一种与猪背膘厚关联的GHR基因内SINE转座子多态分子标记、检测方法及应用有效

专利信息
申请号: 201910409360.X 申请日: 2019-05-16
公开(公告)号: CN110157811B 公开(公告)日: 2022-06-14
发明(设计)人: 陈才;宋成义;郑尧;顾浩;王宵燕;高波;沈丹;王赛赛;王亚丽;李奎 申请(专利权)人: 扬州大学
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888;C12N15/11
代理公司: 南京纵横知识产权代理有限公司 32224 代理人: 薛海霞;董建林
地址: 225009 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 猪背膘厚 关联 ghr 基因 sine 座子 分子 标记 检测 方法 应用
【权利要求书】:

1.用于检测与猪背膘厚相关的GHR基因内SINE转座子多态分子标记的试剂在筛选猪背膘厚性状中的应用,其特征在于,所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO: 1所示,所述SEQ ID NO: 1中SINE序列为插入状态,该序列的第200到493位点存在一个反向SINE的插入多态;当SINE序列为缺失状态,SEQ ID NO: 1的第200到493位点不存在,第199位点的碱基与第494位点的碱基直接相连;该核苷酸序列的第200到493位点之间存在一个反向SINE转座子的插入多态性位点;该位点表现为SINE+/+、SINE+/-或SINE-/-三种基因型,纯合插入基因型SINE+/+的个体背膘厚显著小于纯合无插入基因型SINE-/-的个体。

2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,检测方法包括以下步骤:

(1)根据SEQ ID NO: 1中反向SINE转座子插入多态性位点两侧的序列设计检测引物;

(2)以待检测猪个体的基因组DNA为模板进行PCR扩增,获得PCR扩增产物;

(3)将PCR扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,并根据电泳结果判定基因型。

3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,步骤(2)中,PCR扩增所用正向引物序列如SEQ ID NO: 2所示,反向引物序列如SEQ ID NO: 3所示。

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