[发明专利]一种维氏气单胞菌的LAMP检测引物组合物及试剂盒在审
申请号: | 201910451403.0 | 申请日: | 2019-05-28 |
公开(公告)号: | CN110106268A | 公开(公告)日: | 2019-08-09 |
发明(设计)人: | 李梅;赖阳武;许承佳;李丹;吴秋萍 | 申请(专利权)人: | 电子科技大学中山学院 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6844;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/01 |
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地址: | 528400 广东省中山市石岐*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 气单胞菌 引物组合物 试剂盒 试液 检测 阳性对照液 基因组DNA 准确度 灵敏度 内引物 外引物 无菌水 | ||
一种维氏气单胞菌的LAMP检测引物组合物及试剂盒。引物组合物包括两条外引物AV‑F3引物和AV‑B3引物、两条内引物AV‑FIP引物和AV‑BIP引物。检测维氏气单胞菌的试剂盒包含A溶液、B溶液和C试液:A溶液中含有上述维氏气单胞菌的LAMP检测引物组合物、dNTPs、10×lamp buffer、Mg2+和BstDNA聚合酶;B溶液为维氏气单胞菌基因组DNA阳性对照液;C试液为无菌水。采用本发明的检测维氏气单胞菌的试剂盒对维氏气单胞菌进行检测,具有较高的准确度、灵敏度和特异性。
技术领域
本发明属于水产病原菌及食源性致病菌检测技术领域,具体地,涉及一种维氏气单胞菌的LAMP检测引物组合物及试剂盒。
背景技术
维氏气单胞菌是引起水产动物疾病的重要病原菌及食源性致病菌,是人-鱼共患致病菌,可以引发人急性腹泻、脑膜炎、肠胃炎、菌血症等疾病。维氏气单胞菌具有气单胞菌属典型的毒力因子,如气溶素、肠毒素等,对水产动物有较高的致死率,给养殖业造成了巨大损失。维氏气单胞菌具有气单胞菌属典型的毒力因子气溶素、肠毒素等,目前,维氏气单胞菌的鉴定主要是靠生理生化方法和分子生物学方法。由于生理生化鉴定费时费力,相对依赖实验室条件,并且分类依据和判定标准更新滞后,结果可靠性不强,有报道称API20E细菌鉴定系统误把维氏气单胞菌鉴定为嗜水气单胞菌。分子生物学方法基于16SrRNA的分析技术也用于鉴定维氏气单胞菌,但由于气单胞菌属的16SrRNA有较高相似性,种与种的相似性多超过98%,仅利用于16SrRNA基因相似性往往难以准确检测维氏气单胞菌。
日本科学家Notomi等人发明了一种新的核酸扩增技术环介导等温扩增技术(Loop-Mediated Isothermal Amplification,LAMP),其基本原理是针对靶基因的6个区域,设计4条特异性引物(FIP,BIP,F3,B3),在链置换BstDNA聚合酶的作用下于恒温60℃-65℃扩增60min左右,即可进行循环扩增,且效率可达109-1010个数量级。LAMP反应具有较高的专一性,只有四条引物在靶基因中的6个不同区域完全匹配才能进行扩增。这种技术具有的特点是特异性强、高效、快速、简便、灵敏度高。目前,在微生物检测方面,LAMP技术对沙门氏菌、副溶血弧菌、分歧杆菌、嗜水气单胞菌以及病毒方面的流感病毒、口蹄疫病毒检测等已有研究,但对于建立维氏气单胞菌LAMP检测方法的研究还处于相对匮乏的水平。
发明内容
本发明的目的是提供一种维氏气单胞菌的LAMP检测引物组合物及试剂盒,以解决上述技术问题中的至少一个。
根据本发明的一个方面,提供一种维氏气单胞菌的LAMP检测引物组合物:包括两条外引物AV-F3引物和AV-B3引物、两条内引物AV-FIP引物和AV-BIP引物;AV-F3引物的核苷酸序列为SEQ ID NO.2,AV-B3引物的核苷酸序列为SEQ ID NO.3,AV-FIP引物的核苷酸序列为SEQ ID NO.4,AV-BIP引物的核苷酸序列为SEQ ID NO.5。
根据本发明的另一个方面,提供一种维氏气单胞菌的LAMP检测引物组合物在制备检测维氏气单胞菌的试剂盒中的应用。
根据本发明的另一个方面,提供一种检测维氏气单胞菌的试剂盒:包括A溶液,A溶液中含有上述维氏气单胞菌的LAMP检测引物组合物、dNTPs、10×lamp buffer、Mg2+和BstDNA聚合酶。
优选地,A溶液中的引物组合物满足如下浓度比例:AV-FIP引物:AV-BIP引物:AV-F3引物:AV-B3引物=6:6:1:1。
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