[发明专利]一种检测端粒内氧化性损伤的荧光化学传感器及其检测方法和应用有效
申请号: | 201910478044.8 | 申请日: | 2019-06-03 |
公开(公告)号: | CN110144384B | 公开(公告)日: | 2023-03-24 |
发明(设计)人: | 张春阳;张艳;华若男;相东雪 | 申请(专利权)人: | 山东师范大学 |
主分类号: | C12Q1/6825 | 分类号: | C12Q1/6825 |
代理公司: | 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 | 代理人: | 郑平 |
地址: | 250014 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 端粒 氧化 损伤 荧光 化学 传感器 及其 方法 应用 | ||
1.一种检测端粒内氧化性损伤的荧光化学传感器,其特征在于,所述荧光化学传感器至少包括信号探针、捕获探针和辅助探针;
所述信号探针为具有脱嘌呤嘧啶位点的富T单链DNA序列,所述信号探针5'端修饰有生物素,所述信号探针3'端修饰有荧光基团;
所述荧光基团为AF488;
所述信号探针的碱基序列如下:
5'-Biotin- TTT TTT TTT XTT TTT TTT-AF488-3';
其中X代表脱嘌呤嘧啶位点;
所述捕获探针的碱基序列如下:
CCT AAC CCT AAC CCT AAC CCT TTT-Biotin;
所述辅助探针的碱基序列如下:
5'-CCT AAC CCT AAC CCT AAddC-3';
所述捕获探针用于捕获富集端粒,其具有与端粒杂交的单链DNA序列,所述捕获探针3'端进行生物素化修饰;
所述辅助探针为3'端用ddC修饰的单链DNA序列,其与单链端粒杂交形成甲酰胺嘧啶[fapy]-DNA糖基化酶的dsDNA底物。
2.如权利要求1所述的检测端粒内氧化性损伤的荧光化学传感器,其特征在于,所述信号探针与链霉抗生物素蛋白包被的磁珠进行缀合。
3.如权利要求1所述的检测端粒内氧化性损伤的荧光化学传感器,其特征在于,所述荧光化学传感器还包括甲酰胺嘧啶 [fapy]-DNA糖基化酶、末端脱氧核苷酸转移酶TdT、核酸内切酶IV和T4-多核苷酸激酶。
4.如权利要求1-3任一项所述的检测端粒内氧化性损伤的荧光化学传感器,其特征在于,所述端粒内氧化性损伤包括8-oxoG损伤。
5.基于权利要求1-4任一项所述荧光化学传感器检测端粒内氧化性损伤的方法,其特征在于,所述方法包括:
S1、用dsDNA片段酶消化提取基因组DNA;
S2、加入捕获探针和链霉抗生物素蛋白包被的磁珠孵育处理;
S3、加入TdT进行孵育处理;
S4、加入辅助探针、甲酰胺嘧啶 [fapy]-DNA糖基化酶进行孵育处理;
S5、加入TdT、核酸内切酶IV和磁珠偶联信号探针进行孵育处理;
S6、磁分离后,对上清液进行单分子检测;
不以疾病的诊断和治疗为目的。
6.如权利要求5所述的方法,其特征在于,所述步骤S2中,孵育处理条件为于90~100℃温育3~8分钟。
7.如权利要求6所述的方法,其特征在于,所述孵育处理条件为于95℃温育5分钟。
8.如权利要求5所述的方法,其特征在于,所述步骤S3中,孵育处理过程中还加入ddCTP;
孵育处理条件为于30~40℃孵育20~40分钟。
9.如权利要求8所述的方法,其特征在于,所述孵育处理条件为于37℃孵育30分钟。
10.如权利要求5所述的方法,其特征在于,所述步骤S4中,孵育处理条件为30~40℃下孵育40~80分钟。
11.如权利要求10所述的方法,其特征在于,孵育处理条件为37℃下孵育60分钟。
12.如权利要求5所述的方法,其特征在于,所述步骤S5中,孵育处理条件为30~40℃下孵育40~80分钟。
13.如权利要求12所述的方法,其特征在于,孵育处理条件为37℃下孵育60分钟。
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