[发明专利]构建匹配抗原表位和抗体识别区及编码基因数据库的方法以及数据库、存储介质和电子设备有效
申请号: | 201910479473.7 | 申请日: | 2019-06-04 |
公开(公告)号: | CN110318100B | 公开(公告)日: | 2023-07-11 |
发明(设计)人: | 冷博;靳鹏;张倩;蔡波;邹莉;李洪 | 申请(专利权)人: | 四川世纪长青干细胞生物科技发展有限公司 |
主分类号: | C40B50/06 | 分类号: | C40B50/06;C40B40/10;C40B40/08;G16B50/30;G16B30/00 |
代理公司: | 成都东恒知盛知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 51304 | 代理人: | 何健雄 |
地址: | 610000 四川省成*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 构建 匹配 抗原 抗体 识别 编码 基因 数据库 方法 以及 存储 介质 电子设备 | ||
1.一种构建匹配抗原表位和抗体识别区及编码基因数据库的方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)对细胞样本进行第一次免疫图谱检查,明确细胞样本当前免疫能力,以此作为基线记录在案;
2)使用肿瘤特异性集群靶标检测技术已有靶标库中每种特定抗原表位,分别刺激细胞样本,使其产生特定适应性免疫能力,即包含特定V(D)J的TCR;
3)接受刺激一周后,对细胞样本进行第二次免疫图谱检查,将所得三维柱状图与基线对比,明显升高的即为该特定抗原表位的对应抗体识别区;
4)进一步对含有此种V(D)J的细胞样本做基因测序,获得编码此种V(D)J的基因序列,以及构成此种V(D)J的氨基酸序列;
5)对步骤1)至步骤4)中获得的数据整理记录;
6)整合步骤5)中记录的氨基酸序列,得到特定抗原表位与特定抗原识别区及其编码基因的对应关系,构建形成匹配抗原表位和抗体识别区及编码基因的数据库;
还包括以下步骤:
对步骤4)中筛选得到的氨基酸序列删除重复,建立集合;
所述细胞样本包括淋巴细胞;
步骤1)中所述的免疫图谱检查的具体方法为:提取分离出的淋巴细胞的RNA或DNA,构建文库后进行NGS测序。
2.根据权利要求1所述的构建匹配抗原表位和抗体识别区及编码基因数据库的方法,其特征在于,步骤6)中对应关系具体为:
对特定抗原表位注释,注释信息包括能够产生相对应的适应性免疫能力的特定定抗原识别区及其编码基因;
对特定抗原识别区注释,注释信息包括编码基因以及能够对哪些特定抗原表位产生相对应的适应性免疫能力。
3.根据权利要求2所述的构建匹配抗原表位和抗体识别区及编码基因数据库的方法,其特征在于,步骤6)中对应关系还包括:将特定抗原表位与相对应的特定定抗原识别区相互关联。
4.根据权利要求1所述的构建匹配抗原表位和抗体识别区及编码基因数据库的方法,其特征在于,还包括以下步骤:
重复步1)至步骤5),步骤6)对多次重复结果进行整合。
5.一种匹配抗原表位和抗体识别区及编码基因数据库,其特征在于,该数据库采用权利要求1-4任一所述构建方法构建而成。
6.一种存储介质,其特征在于,所述存储介质内存储有权利要求5所述的匹配抗原表位和抗体识别区及编码基因数据库。
7.一种电子设备,其特征在于,包括权利要求6所述的存储介质。
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