[发明专利]构建匹配抗原表位和抗体识别区及编码基因数据库的方法以及数据库、存储介质和电子设备

说明书

本发明公开了一种构建匹配抗原表位和抗体识别区及编码基因数据库的方法以及数据库、存储介质和电子设备，其中构建方法包括以下步骤：1)对细胞样本进行第一次免疫图谱检查；2)使用肿瘤特异性集群靶标检测技术已有靶标库中每种特定抗原表位，分别刺激细胞样本；3)接受刺激一周后，对细胞样本进行第二次免疫图谱检查；4)进一步对含有此种V(D)J的细胞样本做基因测序，获得编码此种V(D)J的基因序列，以及构成此种V(D)J的氨基酸序列；5)对步骤1)至步骤4)中获得的数据整理记录；6)得到特定抗原表位与特定抗原识别区及其编码基因的对应关系，构建形成匹配抗原表位和抗体识别区及编码基因的数据库。

技术领域

本发明属于生物技术领域，具体地说，涉及一种构建匹配抗原表位和抗体识别区及编码基因数据库的方法以及数据库、存储介质和电子设备。

背景技术

目前国内临床上主要通过化验血液肿瘤指标、影像学检查(B超、CT、MRI、PET-CT等)及近年来的风险基因检测、循环肿瘤细胞检测等方式检查肿瘤信息，但这些方法的敏感性和特异性均不高，发现有异常时往往已是中晚期。对于恶性肿瘤而言，早发现早治疗，才能有效的提高生存率。随着分子生物学和免疫学的不断深入研究，研究者已经认识到肿瘤的检测已上升到了抗原表位肽水平。而在现有技术中，针对一些肿瘤疫苗的开发，缺少相应的数据支撑，也缺少构建匹配抗原表位和抗体识别区及编码基因数据库的方法。因此，有必要提供建匹配抗原表位和抗体识别区及编码基因数据库的方法。

发明内容

本发明的一个目的是提供一种构建匹配抗原表位和抗体识别区及编码基因数据库的方法的技术方案。

根据本发明的一个方面，本发明提供一种构建匹配抗原表位和抗体识别区及编码基因数据库的方法，包括以下步骤：

1)对细胞样本进行第一次免疫图谱检查，明确细胞样本当前免疫能力，以此作为基线记录在案；

2)使用肿瘤特异性集群靶标检测技术已有靶标库中每种特定抗原表位，分别刺激细胞样本，使其产生特定适应性免疫能力，即包含特定V(D)J的TCR；

3)接受刺激一周后，对细胞样本进行第二次免疫图谱检查，将所得三维柱状图与基线对比，明显升高的即为该特定抗原表位的对应抗体识别区；

4)进一步对含有此种V(D)J的细胞样本做基因测序，获得编码此种V(D)J的基因序列，以及构成此种V(D)J的氨基酸序列；

5)对步骤1)至步骤4)中获得的数据整理记录；

6)整合步骤5)中记录的氨基酸序列，得到特定抗原表位与特定抗原识别区及其编码基因的对应关系，构建形成匹配抗原表位和抗体识别区及编码基因的数据库。

可选地，还包括以下步骤：

对步骤4)中筛选得到的氨基酸序列删除重复，建立集合。

可选地，所述细胞样本包括淋巴细胞。

可选地，步骤1)中所述的免疫图谱检查的具体方法为：提取分离出的淋巴细胞的RNA或DNA，构建文库后进行NGS测序。

可选地，步骤6)中对应关系具体为：

对特定抗原表位注释，注释信息包括能够产生相对应的适应性免疫能力的特定定抗原识别区及其编码基因；

对特定抗原识别区注释，注释信息包括编码基因以及能够对哪些特定抗原表位产生相对应的适应性免疫能力。

可选地，步骤6)中对应关系还包括：将特定抗原表位与相对应的特定定抗原识别区相互关联。

可选地，还包括以下步骤：

重复步1)至步骤5)，步骤6)对多次重复结果进行整合。