[发明专利]六倍体I.trifida基因组特异SNP分子标记引物及应用有效
| 申请号： | 201910486260.7 | 申请日： | 2019-06-05 |
| 公开（公告）号： | CN110106281B | 公开（公告）日： | 2023-03-31 |
| 发明（设计）人： | 冯俊彦;蒲志刚;李明;张聪;刘家榜;赵珊;屈会娟;黎青 | 申请（专利权）人： | 四川省农业科学院生物技术核技术研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
| 代理公司： | 成都方圆聿联专利代理事务所(普通合伙) 51241 | 代理人： | 李鹏 |
| 地址： | 610061 四川*** | 国省代码： | 四川;51 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 六倍体 trifida 基因组 特异 snp 分子 标记 引物 应用 | ||
1.六倍体I.trifida基因组特异SNP分子标记引物对组合物，其特征在于，所述引物对组合物由四组引物对组成，四组引物对分别为命名为SHS6tr-6-1、SHS6tr-6-2、SHS6tr-6-3和SHS6tr-6-4，其中，SHS6tr-6-1的前向引物序列如SEQ ID No.1所示，后向引物序列如SEQID No.2所示；SHS6tr-6-2的前向引物序列如SEQ ID No.3所示，后向引物序列如SEQ IDNo.4所示；SHS6tr-6-3的前向引物序列如SEQ ID No.5所示，后向引物序列如SEQ ID No.6所示；SHS6tr-6-4的前向引物序列如SEQ ID No.7所示，后向引物序列如SEQ ID No.8所示。
2.权利要求1所述的引物对组合物在六倍体I.trifida基因组检测上的应用。
3.一种六倍体I.trifida基因组特异SNP基因分型的检测方法，其特征在于，包括如下步骤：
(1)提取待检测甘薯的DNA；
(2)以步骤(1)提取的DNA为模板，以权利要求1所述的SHS6tr-6-1、SHS6tr-6-2、SHS6tr-6-3或SHS6tr-6-4中的任一引物对进行PCR扩增；
(3)将步骤(2)的扩增产物加入高分辨熔解曲线分析系统中进行基因分型检测。
4.根据权利要求3所述的检测方法，其特征在于，步骤(1)中，提取待检测甘薯的DNA的方法为：取新鲜幼嫩叶片，液氮研磨成细粉后加预热至65℃采用CTAB法提取参试材料DNA，溶于1×TE溶液中，加入RNA酶至终浓度50μg/μl，120V恒定电压下，1.5％琼脂糖凝胶电泳30分钟，检测DNA浓度及质量。
5.根据权利要求3所述的检测方法，其特征在于，步骤(2)中，PCR扩增的反应体系为：
PCR扩增条件为：
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