[发明专利]一种鉴别发酵生产辅酶A过程中的菌种种属的试剂盒、方法和引物对在审
申请号: | 201910486764.9 | 申请日: | 2019-06-05 |
公开(公告)号: | CN110184366A | 公开(公告)日: | 2019-08-30 |
发明(设计)人: | 刘弘忍;汪雅雯;丁金国;黄臻辉 | 申请(专利权)人: | 上海上药第一生化药业有限公司 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/686;C12Q1/04;C12N15/11 |
代理公司: | 上海弼兴律师事务所 31283 | 代理人: | 薛琦;吕学辰 |
地址: | 200240 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 引物 试剂盒 辅酶A 发酵 核苷酸序列 鉴别 棒杆菌 停滞 电泳检测 反向引物 菌种鉴定 正向引物 直接发酵 菌种 生产 检测 分析 | ||
1.一种鉴别发酵生产辅酶A过程中的菌种种属的试剂盒,其包括PCR反应体系,其特征在于,所述PCR反应体系至少包括一种引物对;
所述引物对的正向引物的核苷酸序列如序列表中SEQ ID NO.1所示,反向引物的核苷酸序列如序列表中SEQ ID NO.2所示。
2.如权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,在所述的PCR反应体系中,所述正向引物和所述反向引物的终浓度均为0.2~1μM,优选0.3~0.5μM,更优选0.4μM。
3.如权利要求1或2所述的试剂盒,其特征在于,所述的PCR反应体系还包括PCR反应缓冲液、dNTP和DNA聚合酶;其中:
所述PCR反应体系中Mg2+的终浓度优选2mM;
所述dNTP中,dATP、dGTP、dTTP和dCTP的浓度均优选0.2mM;
所述DNA聚合酶优选Taq酶,所述DNA聚合酶的活力优选0.025U/μl。
4.如权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述反应体系包括1μL浓度为10μM的上游引物、1μL浓度为10μM的下游引物、12.5μL 2×premix Taq以及9.5μL双蒸水;
较佳地,所述的试剂盒还包括阳性对照和/或阴性对照;所述的阳性对照优选停滞棒杆菌基因组DNA,所述的阴性对照优选双蒸水。
5.如权利要求1~4任一项所述的试剂盒,其特征在于,所述菌种选自直接发酵产辅酶A的菌种中的一种或者多种,所述菌种包括停滞棒杆菌。
6.一种鉴别发酵产辅酶A过程中的菌种种属的引物对,其特征在于,所述引物对针对停滞棒杆菌的16srDNA设计,所述引物对的正向引物的核苷酸序列如序列表中SEQ ID NO.1所示,反向引物的核苷酸序列如序列表中SEQ ID NO.2所示。
7.如权利要求6所述的引物对在鉴别发酵产辅酶A过程中的菌种种属的试剂盒或者试剂中的应用;
较佳地,所述菌种选自直接发酵产辅酶A的菌种中的一种或者多种,所述菌种包括停滞棒杆菌。
8.一种鉴别发酵产辅酶A中菌种种属的方法,其特征在于,其包括以下步骤:
1)提取待检样品中的DNA;
2)利用权利要求1~5任一项所述试剂盒中的PCR反应体系扩增上述DNA得PCR产物;
3)电泳检测所述PCR产物。
9.如权利要求8所述的方法,其特征在于,所述步骤2)中所述扩增的PCR反应程序为:(1)95℃预变性1~5min,优选3min;(2)95℃变性15~60s,优选30s:(3)59℃退火15~60s,优选30s;(4)72℃延伸60~120s,优选90s;(5)步骤(2)~(4)循环25~35次,优选30次;(6)72℃延伸5~15min,优选10min;(7)4℃终止。
10.如权利要求8所述的方法,其特征在于,所述步骤3)所述电泳为琼脂糖凝胶电泳;优选质量百分比浓度为0.8~1.2%,更优选质量百分比浓度为1%的琼脂糖凝胶电泳。
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