[发明专利]以SMNP作为对照检测SMN基因拷贝数的方法

权利要求书

1.一种能够扩增基因组中SMN1和/或SMN2基因以及SMNP基因的目标区域的特异性引物组合在制备检测目标基因组中运动神经元存活基因SMN1和/或SMN2拷贝数的试剂盒中的用途，其中所述特异性引物组合能够扩增基因组中SMN1和/或SMN2基因以及SMNP基因的目标区域，然后以SMNP扩增产物为参照，通过比较扩增产物相对量确定SMN1和/或SMN2基因的拷贝数；

其中，针对SMN1基因的特异性引物组合为引物组合1，其能够扩增基因组中SMN1和SMNP基因但不扩增SMN2基因的目标区域，并且检测结果能够区分SMN1扩增产物和SMNP扩增产物；和/或

针对SMN2基因的特异性引物组合为引物组合2，其能够扩增基因组中SMN2和SMNP基因但不扩增SMN1基因的目标区域，并且检测结果能够区分SMN2扩增产物和SMNP扩增产物；

SMN1、SMN2和SMNP的扩增产物长度不同。

2.权利要求1的用途，其中所述检测目标基因组中运动神经元存活基因SMN1和/或SMN2拷贝数包括

1）提供含有目标基因组DNA的样品；

2）在所述引物组合存在下，以步骤1）所述基因组DNA为模板，扩增引物组合所针对的SMN1和/或SMN2基因以及SMNP基因的目标区域；和

3）检测扩增产物，以SMNP扩增产物为参照，确定SMN1和/或SMN2基因在目标基因组中的拷贝数。

3.权利要求2的用途，其中在步骤3）中检测扩增产物的长度和量，并且其中

对于引物组合1，SMN1和SMNP的扩增产物长度不同；和/或

对于引物组合2，SMN2和SMNP的扩增产物长度不同。

4.权利要求2的用途，其中在步骤3）中通过选自以下的方法检测扩增产物：毛细管电泳、荧光定量和质谱。

5.权利要求2的用途，其中在步骤3）中检测扩增产物的序列和量。

6.权利要求1的用途，还包括检测SMN1和SMN2基因之间的基因转换。

7.权利要求1的用途，其中所述引物组合1的第一引物位于SMN1和SMNP基因的第一共有序列区域，并且该第一引物序列与所述第一共有序列的至少一部分是一致的或互补的，所述共有序列是SEQ ID NO: 1（ATGAGAATTCTAGTAGGGATGTAG）。

8.权利要求1的用途，其中所述引物组合1的第二引物序列位于SMN1和SMNP基因的第二共有序列区域，但SMN2基因在对应区域的序列与该第二共有序列不一致，并且所述第二引物序列与所述第二共有序列的至少一部分是互补的或一致的，所述第二共有序列是SEQ IDNO: 2（ATGTTAAAAAGTTGAAAGGTTAATGTAAAACA）。

9.权利要求1的用途，其中所述引物组合2的第三引物序列位于SMN2和SMNP基因的第三共有序列区域，但SMN1基因在对应区域的序列与该第三共有序列不一致，并且所述第三引物序列与所述第三共有序列的至少一部分是互补的或一致的，所述第三共有序列是SEQ IDNO: 3（ACTGGTTGGTTGTGTGGAA）。

10.权利要求1的用途，其中所述引物组合2的第四引物序列位于SMN2和SMNP基因的第四共有序列区域，并且该第四引物序列与所述第四共有序列的至少一部分是一致的或互补的，所述共有序列是SEQ ID NO: 4（GATCTGTCTGATCGTTTCTTTAGTGGTGTCATTTA）或SEQ IDNO: 5（AATGAGGCCAGTTATCTTCTATAAC）。

11.权利要求1的用途，其中所述引物组合1的第一引物和第二引物分别包含SEQ IDNO: 7和SEQ ID NO: 6所示序列或由其组成；所述引物组合2的第三引物和第四引物分别包含SEQ ID NO: 8和SEQ ID NO: 9所示序列或由其组成。