[发明专利]一种快速鉴定禾谷镰刀菌产毒基因型的试剂盒及其应用有效
申请号: | 201910520373.4 | 申请日: | 2019-06-17 |
公开(公告)号: | CN110172526B | 公开(公告)日: | 2022-05-13 |
发明(设计)人: | 王建华;陈建平;刘玉洋;赵志勇;张静雅;杨俊花;杨宪立 | 申请(专利权)人: | 上海市农业科学院 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/04;C12R1/77 |
代理公司: | 焦作加贝专利代理事务所(普通合伙) 41182 | 代理人: | 冯新志 |
地址: | 201403 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 快速 鉴定 禾谷 镰刀 菌产毒 基因型 试剂盒 及其 应用 | ||
1.试剂盒在快速鉴定禾谷镰刀菌产毒基因型中的应用,所述试剂盒包含由引物ComF、引物3A-R、引物15A-R、引物NIV-R组成的引物组合,其中,引物ComF、引物3A-R、引物15A-R、引物NIV-R分别具有SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示的核苷酸序列,所述应用包括以下步骤:
获取待鉴定禾谷镰刀菌的基因组DNA;
以所述DNA为模板,利用所述的试剂盒进行PCR扩增;
检测PCR扩增产物,以确定禾谷镰刀菌产毒基因型,
如果PCR扩增产物为836bp,则待鉴定禾谷镰刀菌能够产生3-乙酰脱氧雪腐镰刀菌烯醇;如果PCR扩增产物为1116bp,则待鉴定禾谷镰刀菌能够产生15-乙酰脱氧雪腐镰刀菌烯醇;如果PCR扩增产物为1404bp,则待鉴定禾谷镰刀菌能够产生雪腐镰刀菌烯醇。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述试剂盒还包含DNA聚合酶、dNTPs和PCR缓冲液。
3.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,利用测序法检测PCR扩增产物。
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,利用琼脂糖凝胶电泳法检测PCR扩增产物。
5.根据权利要求1-4任一所述的应用,其特征在于,其中PCR扩增的体系为:总体积20μL:2×EasyTaq PCR SuperMix 10μL,10μmol/L上游引物1μL,10μmol/L下游引物1μL,DNA模板50ng,ddH2O补至20μL。
6.根据权利要求5所述的应用,其特征在于,其中PCR扩增的程序为:94℃预变性3min;94℃变性30s,62℃复性40s,72℃延伸90s,25个循环;72℃延伸5min。
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