[发明专利]一种与大豆植株分枝数显著相关的InDel标记及其应用

说明书

本发明公开了一种与大豆植株分枝数显著相关的InDel标记及其应用，涉及遗传育种技术领域，通过SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5所述的序列为引物对大豆基因组DNA进行PCR扩增，并对扩增产物判断，若扩增产物仅含1条主带，则对应待测大豆DNA没问题且植株分枝数多；若扩增产物包含两条主带，则对应待测大豆DNA没问题且植株分枝数少；本发明提供的方法能够有效、快速的刷选出大豆植株为分枝数多或少的品种，实现了筛选优异大豆植株材料的第一步，为深入开展基因功能研究和大豆分枝数分子改良提供了方法基础。

技术领域

本发明涉及遗传育种技术领域，具体涉及一种与大豆植株分枝数显著相关的InDel标记以及鉴定大豆植株分枝数多少的方法。

背景技术

大豆是世界上最重要的一种油料经济作物，同时也是最大的食用油和蛋白的来源。随着对大豆需求的增长，利用大豆品种的遗传改良来提高大豆产量将变得越来越重要。优化植株形态结构、培育具有最优分枝的大豆品种是植物育种家一直追求的育种目标。

常规育种年限长、效率低且成本高，而分子标记反映生物个体基因组DNA片段的差异，直接反应种质资源本质，具有高效、准确以及经济等优点，大幅缩短育种周期，是传统育种技术的有力补充SNP分子标记具有数量多、遗传稳定等优点，基于酶切扩增多态性序列标记技术(CAPS)的SNP分子标记检测方法，主要是将PCR扩增产物中含SNP位点的DNA片段进行限制性酶切分析，是SNP分子标记的检测方法之一。InDel标记是由插入/缺失位点两侧的基因序列所设计的特异性引物，根据PCR产物片段大小可直接快速的进行检测，具有准确性高、稳定性好以及成本低等优势。InDel标记相比较与CAPS标记来说，耗时短、成本低及操作简便。目前已广泛应用于植物种质资源分析及分子标记辅助育种。

大豆植株分枝数是影响大豆品质的重要组分因素，而现有技术中并未见报道可对大豆植株分枝数多少进行有效判断的分子生物学方法；而现有技术中，虽然存在对大豆植株其它性状进行分子筛选的方法，但是多数存在筛选技术不稳定、时间长、技术繁琐等问题。

因此，如何避免上述风险，是急需解决的技术问题。

发明内容

本发明的目的在于克服现有技术的不足，提供了一种与大豆植株分枝数显著相关的InDel标记及其应用，以解决现有技术中不存在对大豆植株分枝数多少有效筛选、筛选技术时间长等技术问题。

本发明是通过以下技术方案实现的：

本发明提供了一种与大豆植株分枝数显著相关的InDel标记，所述InDel标记的核苷酸序列具体如SEQ ID NO.1：TGTCTGTGAAGT。

本发明还提供一种上述的InDel标记在鉴定大豆植株分枝数中的应用。

本发明还提供一种用于扩增上述InDel标记的引物对，所述引物对的序列具体为：

1F：GCAAATCTGTCTGTGAAGTACG SEQ ID NO.2

1R：TATCCGAATTGCAAAAGCGCA SEQ ID NO.3。

本发明还提供一种上述的引物对在鉴定大豆植株分枝数中的应用。

本发明还提供一种双引物对快速鉴定大豆植株分枝数多少的方法，该方法包括以下步骤：

步骤1、设计鉴定待测大豆基因组DNA是否有缺陷的引物对

2F：GTGTCATTCCTGGCATACAAAAGT SEQ ID NO.4

2R：TAATGCCTCCTGCCCTGTTG SEQ ID NO.5

步骤2、提取待测大豆基因组DNA