[发明专利]可用于肿瘤鉴定的标记物STAMP-EP11及其检测试剂

权利要求书

1.检测分离的核酸的CpG位点甲基化水平的试剂在制备检测肿瘤的试剂或试剂盒中的用途，所述分离的核酸选自(1)-(4)：

(1)SEQ ID NO:1所示核苷酸序列的核酸；

(2)SEQ ID NO:1中第27～48位、第1～544位或第571～1014位所示的核酸的片段；

(3)(1)的核酸或片段的反义链核酸，其核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示；

(4)(2)的核酸的片段的反义链核酸；

所述肿瘤为乳腺癌、结直肠癌、食管癌、白血病、肝癌、肺癌或胰腺癌。

2.如权利要求1所述的用途，其特征在于，所述检测分离的多核苷酸的CpG位点甲基化水平的试剂是引物或探针。

3.如权利要求2所述的用途，其特征在于，所述引物为：

核苷酸序列如SEQ ID NO:5和6所示的引物；或

核苷酸序列如SEQ ID NO:7和8所示的引物。

4.如权利要求2所述的用途，其特征在于，所述引物为：核苷酸序列如SEQ ID NO:9和10所示的引物。

5.如权利要求1所述的用途，其特征在于，将选自(1)-(4)的核酸进行转变，使修饰的CpG位点的胞嘧啶C不变、非修饰的胞嘧啶转变为T或U；之后进行检测。

6.如权利要求5所述的用途，其特征在于，将(1)的多核苷酸进行转变后，获得如SEQ IDNO:2所示核苷酸序列的核酸。

7.如权利要求5所述的用途，其特征在于，将(3)的多核苷酸进行转变后，获得如SEQ IDNO:4所示核苷酸序列的核酸。

8.如权利要求5所述的用途 ，其特征在于，所述肿瘤的样本包括：石蜡包埋样本、血液样本、胸腔积液样本以及肺泡灌洗液样本、腹水及灌洗液样本、胆汁样本、粪便样本、尿液样本、唾液样本、痰液样本、脑脊液样本、细胞涂片样本、宫颈刮片或刷片样本、组织及细胞活检样本。

9.如权利要求1所述的用途，其特征在于，所述试剂盒中包括：容器，以及位于容器中的检测肿瘤的试剂，所述试剂为：核苷酸序列如SEQ ID NO:5和6所示的引物；或核苷酸序列如SEQ ID NO:7和8所示的引物。

10.如权利要求1所述的用途，其特征在于，所述试剂盒中包括：容器，以及位于容器中的检测肿瘤的试剂，所述试剂为：核苷酸序列如SEQ ID NO:9和10所示的引物。

11.检测待测样品的甲基化谱式的方法，所述方法不是诊断性的方法，其特征在于，包括：提取待测样品的核酸；以及检测所提取的核酸中靶序列的CpG位点修饰情况，所述的靶序列是选自(1)-(4)的分离的核酸：

(1)SEQ ID NO:1所示核苷酸序列的核酸；

(2)SEQ ID NO:1中第27～48位、第1～544位或第571～1014位所示的核酸的片段；

(3)(1)的核酸或片段的反义链核酸，其核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示；

(4)(2)的核酸的片段的反义链核酸。

12.如权利要求11所述的方法，其特征在于，检测所提取的核酸中靶序列的CpG位点修饰情况的方法包括：甲基化芯片法、qPCR法、数字PCR法、二代测序法、三代测序法、全基因组甲基化测序法、DNA富集检测法、HPLC法、MassArray、甲基化特异PCR、或它们的组合。

13.如权利要求11所述的方法，其特征在于，检测所提取的核酸中靶序列的CpG位点修饰情况的方法包括：焦磷酸测序法、重亚硫酸盐转化测序法或简化亚硫酸氢盐测序法。