[发明专利]可用于肿瘤鉴定的标记物STAMP-EP11及其检测试剂

说明书

本发明属于疾病诊断标记物领域。本发明提供了一种可用于肿瘤鉴定的标记物及其检测试剂或试剂盒。在多种临床肿瘤类型的测试中，本发明所述肿瘤标记物可呈现在肿瘤组织中的高度甲基化、而在对应的正常组织中则低甲基化，在肿瘤组织以及癌旁组织中，其能够呈现为具有显著性的差异，并在不同的肿瘤类型中具有广谱适用性。

技术领域

本发明属于肿瘤学领域，更具体地，本发明涉及一种可用于肿瘤鉴定的标记物STAMP-EP11及其检测试剂。

背景技术

肿瘤是威胁人类健康的疾病之一，至今缺少理想的治疗手段和药物。DNA序列改变以外的调控机制异常在肿瘤的发生、发展过程中更为普通和重要，这种不依赖于DNA序列变化的可遗传的调控机制被称为表观遗传学机制，包括组蛋白乙酰化、DNA甲基化、MicoRNA、非编码长RNA等。其中以DNA甲基化研究最为深入，无论在针对个别基因、还是在新兴的全基因组学层面以及功能调控领域都被广泛研究，并且在肿瘤临床实践的诊断和治疗中的DNA甲基化的应用前景也受到了很大的重视。

在肿瘤细胞中，一些原本在正常细胞中处于低甲基化状态的基因呈现出高甲基化的状态并转录失活，受累基因包括抑癌基因、DNA修复基因、细胞周期控制基因和抗凋亡基因等，由此促进了肿瘤的发生发展。DNA甲基化的研究不仅可以从新的角度使人们进一步了解肿瘤的发生发展机制，肿瘤细胞DNA呈现出的异常甲基化谱式已经成为一个新的肿瘤生物标记物的研究领域，而且由于DNA甲基化修饰的可逆性，使其也具有成为分子治疗靶点的可能。

DNA甲基化是指生物体内在DNA甲基转移酶(DNA methyltransferase，DMT)的催化下，以S-腺苷甲硫氨酸(SAM)为甲基供体，将甲基转移到特定的碱基上的过程。在哺乳动物中DNA甲基化主要发生在5’-CpG-3’的C上，生成5-甲基胞嘧啶(5mC)。目前研究DNA甲基化的方法主要有：1.甲基化敏感性内切酶法；2.重亚硫酸盐(Bisulfite)修饰法；3.特异性识别甲基化抗体分析法；4.质谱或色谱分析法等。

尽管本领域目前已经能够通过一定的手段来检测DNA甲基化，但是本领域仍然缺少具有典型性的或具有普适性的、适于检测的肿瘤标记物。并且，人类基因组的复杂性，蛋白-蛋白、蛋白-基因、基因-基因的复杂的相互作用以及越来越多干扰性分子的存在，也使得合适的肿瘤标记物被湮没或表象所掩盖。

本发明人致力于该领域的前沿研究，在本发明人的前期研究中，找到了一部分基于甲基化修饰的肿瘤标记物。但是，仍然有必要找到更多的新型肿瘤标记物，从而为肿瘤的诊断提供更多的途径。

发明内容

本发明的目的在于提供一种来源于人基因组的分离的核酸，可被应用于肿瘤鉴定的标记物STAMP-EP11，本发明还提供了其获得方法，其序列以及其在制备诊断试剂方面的应用，本发明也涉及其诊断试剂或试剂盒等

在本发明的第一方面，提供来源于人基因组的核酸，包括：(1)SEQ ID NO:1所示核苷酸序列的核酸；(2)(1)的核酸的片段，且其中包括至少1个修饰的CpG位点(如2～91个，更具体如3，5，10，15，20，25，30，40，50，60，70，80，90个)；和/或(3)(1)或(2)的核酸或片段的反义链核酸。

在一个优选例中，所述的反义链核酸例如为SEQ ID NO:3所示核苷酸序列的核酸。

在另一优选例中，(2)中，所述来源于人基因组的核酸的片段中存在：SEQ ID NO:1中第27～48位核苷酸序列(对应于004-006号CpG位点)；SEQ ID NO:1中第1～544位核苷酸序列(对应于001～055号CpG位点)；SEQ ID NO:1中第571～1014位核苷酸序列(对应于056～091号CpG位点)；SEQ ID NO:3中第967-988位核苷酸序列(对应于004-006号CpG位点)；SEQ ID NO:3中第471-1014位核苷酸序列(对应于001～055号CpG位点)；或SEQ ID NO:3中第1-444位核苷酸序列(对应于056～091号CpG位点)。