[发明专利]基于合作的基因调控方法和网络有效

专利信息
申请号: 201910550287.8 申请日: 2019-06-24
公开(公告)号: CN110262566B 公开(公告)日: 2022-05-17
发明(设计)人: 朱晓敏;吴梦;包卫东;马力;方涛生;张亮 申请(专利权)人: 中国人民解放军国防科技大学
主分类号: G05D1/12 分类号: G05D1/12;G05B13/04
代理公司: 北京风雅颂专利代理有限公司 11403 代理人: 于洁
地址: 410003*** 国省代码: 湖南;43
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摘要:
搜索关键词: 基于 合作 基因 调控 方法 网络
【权利要求书】:

1.一种基于合作的基因调控方法,其特征在于,包括:

获取目标的蛋白质浓度信息和合作伙伴的蛋白质浓度信息,其中,合作伙伴包括其他智能体和障碍物;

其他所述智能体和所述障碍物共同影响蛋白质浓度信息ci,可被定义为:

其中ci为合作蛋白质浓度,j∈{1,...,ntq+ntj}是探测范围内真实智能体和模拟智能体的序列号,g4,j和g5,j表示由λj激活的基因产生的蛋白质浓度,λj是由智能体j产生的环境输入,ntj是智能体探测到的智能体数量,参数k1和k2分别表示蛋白质浓度g4,j和g5,j对智能体i的影响;

根据所述目标的蛋白质浓度信息和所述合作伙伴的蛋白质浓度信息,获取围捕模式;

所述围捕模式为将智能体调配到目标的包围圈不稳定且容易突破的区域;

利用动力学公式,更新智能体的移动位置,以按照所述围捕模式进行围捕。

2.根据权利要求1所述的基于合作的基因调控方法,其特征在于,所述根据所述目标的蛋白质浓度信息和所述合作伙伴的蛋白质浓度信息,获取围捕模式,还包括:

针对每个所述合作伙伴,根据所述合作伙伴的蛋白质浓度信息,生成相互抑制的两种蛋白质浓度;

根据所述两种蛋白质浓度,生成自身的蛋白质浓度。

3.根据权利要求1所述的基于合作的基因调控方法,其特征在于,所述根据所述目标的蛋白质浓度信息和所述合作伙伴的蛋白质浓度信息,获取围捕模式,还包括:

根据所有所述目标的蛋白质浓度信息,生成相互抑制的两种蛋白质浓度;

根据所述两种蛋白质浓度,生成目标的蛋白质浓度。

4.根据权利要求1所述的基于合作的基因调控方法,其特征在于,所述利用动力学公式,更新移动位置,以按照所述围捕模式进行围捕,还包括:

根据所述围捕模式对每个智能体进行位置调节;

获取所述每个智能体的内部状态;

根据所述内部状态对所述智能体的位置进行更新。

5.一种基于合作的基因调控网络,用于执行权利要求1-4任一所述的基于合作的基因调控方法,其特征在于,包括:

上层网络,用于获取目标的蛋白质浓度信息和合作伙伴的蛋白质浓度信息,并根据所述目标的蛋白质浓度信息和所述合作伙伴的蛋白质浓度信息,获取围捕模式;其中,合作伙伴包括其他智能体和障碍物;

其他所述智能体和所述障碍物共同影响蛋白质浓度信息,可被定义为:

其中j∈{1,...,ntq+ntj}是探测范围内真实智能体和模拟智能体的序列号,g4,j和g5,j表示由λj激活的基因产生的蛋白质浓度,λj是由智能体j产生的环境输入,ntj是智能体探测到的智能体数量,ntq是在t时刻智能体探测范围内模拟智能体的数量,参数k1和k2分别表示蛋白质浓度g4,j和g5,j对智能体i的影响;

根据所述目标的蛋白质浓度信息和所述合作伙伴的蛋白质浓度信息,获取围捕模式;

所述围捕模式为将智能体调配到目标的包围圈不稳定且容易突破的区域;

下层网络,用于利用动力学公式,更新移动位置,以按照所述围捕模式进行围捕。

6.一种计算机可读存储介质,其特征在于,当计算机程序产品中的指令由处理器执行时,执行一种如权利要求1-4任一所述的基于合作的基因调控方法。

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