[发明专利]RET基因突变检测引物组、试剂盒、体系和方法有效

专利信息
申请号: 201910577588.X 申请日: 2019-06-28
公开(公告)号: CN110205364B 公开(公告)日: 2022-11-15
发明(设计)人: 智慧芳;解娜;赵方圆;倪君君 申请(专利权)人: 北京和合医学诊断技术股份有限公司
主分类号: C12Q1/6858 分类号: C12Q1/6858;C12N15/11
代理公司: 北京开阳星知识产权代理有限公司 11710 代理人: 丁继恩
地址: 101111 北京市北京经济技术开发区经*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: ret 基因突变 检测 引物 试剂盒 体系 方法
【权利要求书】:

1.RET基因突变检测引物组,其特征在于,包括下述十个引物对:

用于扩增RET基因第10号外显子的引物对,其上游引物和下游引物的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示;

用于扩增RET基因第11号外显子的引物对,其上游引物和下游引物的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示;

用于扩增RET基因第13号外显子的引物对,其上游引物和下游引物的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6所示;

用于扩增RET基因第14号外显子和第15号外显子的引物对,其上游引物和下游引物的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.8所示;

用于扩增RET基因第16号外显子的引物对,其上游引物和下游引物的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.9和SEQ ID NO.10所示;

所述RET基因突变检测引物组中各引物对的摩尔比为:RET-10:RET-11:RET-13:RET-14/15:RET-16=0.5~2:0.5~2:0.5~2:0.5~2:0.5~2。

2.RET基因突变检测试剂盒,其特征在于,包括:权利要求1所述的RET基因突变检测引物组。

3.根据权利要求2所述的RET基因突变检测试剂盒,其特征在于,进一步包括:利用所述引物对进行目的基因片段PCR扩增反应的试剂。

4.根据权利要求3所述的RET基因突变检测试剂盒,其特征在于,进行目的基因片段PCR扩增反应的试剂,包括:PCR Buffer、dNTP、Mg2+以及DNA聚合酶中的任意一种或多种;和/或,所述RET基因突变检测试剂盒进一步包括以下一种或多种试剂:

用于从样品提取基因组DNA的试剂;

用于处理扩增产物以使得扩增产物能用于测序技术中的试剂;

以及用于对处理后的扩增产物进行测序的试剂。

5.RET基因突变检测反应体系,其特征在于,包括:权利要求1所述的RET基因突变检测引物组。

6.根据权利要求5所述的RET基因突变检测反应体系,其特征在于,进一步包括:DNA聚合酶、PCR反应缓冲液、dNTP和模板DNA。

7.根据权利要求6所述的RET基因突变检测反应体系,其特征在于,所述RET基因突变检测反应体系包括:浓度为20-300nM的所述RET基因突变检测引物组,用量0.2-4.0U的DNA聚合酶,2*PCR反应缓冲液,浓度为200-800μM的dNTP以及用量为10-100ng的模板DNA。

8.根据权利要求6或7所述的RET基因突变检测反应体系,其特征在于,所述模板DNA为人类基因组DNA。

9.用于非诊断目的RET基因突变检测方法,其特征在于,包括:使用权利要求1所述的RET基因突变检测引物组或权利要求2至4任一所述的RET基因突变检测试剂盒或权利要求5至8任一所述的RET基因突变检测反应体系,通过PCR扩增反应扩增RET基因第10、11、13、14、15、16号外显子中的至少一个外显子;PCR扩增反应的反应条件为94~98℃2~10min,然后进行25-40个循环,每个循环中94~98℃10~90s,然后55~68℃10-90s,然后68~72℃30~300s,然后68~72℃5~20min;

通过测序技术对PCR扩增产物进行测序;将测序结果与RET基因的参考序列比对,确定突变位点。

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