[发明专利]一种miRNA数据与转录组数据贯穿分析的方法及系统

说明书

本发明公开了一种miRNA数据与转录组数据贯穿分析的方法及系统，所述方法包括如下步骤：步骤S1，对样本进行小RNA测序，对小RNA测序数据进行生物信息分析，根据miRNA的表达量，筛选得到差异表达的miRNA；步骤S2,对样本进行转录组测序，并对转录组测序数据进行生物信息分析，根据mRNA的表达量，筛选得到差异表达的mRNA；步骤S3，选择小RNA测序和转录组测序得到的差异表达的miRNA和差异表达的mRNA进行后续关联分析，通过本发明，实现了一种适用于任何生物体的miRNA数据和转录组测序数据的贯穿分析技术，有效地提高了数据利用率，同时从不同的层面去挖掘数据之间的潜在联系和有重要研究价值的生物学信息，达到了数据整合的目的。

技术领域

本发明涉及miRNA和转录组学技术领域，特别是涉及一种miRNA数据与转录组数据贯穿分析的方法及系统。

背景技术

转录组被定义为特定物种、组织或细胞类型转录的所有RNA(转录本)的集合，包括mRNA和非编码RNA(non-coding RNA)；非编码RNA主要是指microRNA（miRNA）。

microRNA（miRNA）是一类长度约为19-25nt的内源性非编码RNA，广泛参与基因转录后调控活动，具有高度序列保守性、表达时序性和组织特异性。研究表明miRNA参与各种各样的调节途径，包括发育、病毒防御、造血过程、脂肪代谢等，具有重要的基因表达调控作用。mRNA翻译成肽链的过程是受调控因子调控的，研究表明，多数miRNA具有调控特定的mRNA翻译成蛋白质的作用；成熟的miRNA通过以碱基配对的方式结合到与它互补的mRNA位点上去，影响mRNA的翻译过程，从而实现对基因表达的调控。miRNA及其调控的靶基因的表达，构成了一个非常严密的调控网络，这个网络的精确运行确保了生物体各种生理过程的正常运行；因而，miRNA与mRNA之间相互关系的分析研究，对人类遗传学、生物学、疾病学等都具有重要的参考意义。

随着研究的不断深入，单一组学数据反应的生物学信息具有一定的局限性，不能全面深入地达到预期的研究目的；因此，需要将多组学技术结合进行数据整合，来全面深入地进行科学探究；公开号为CN 104911261 B的中国专利公开了一种研究水稻与病原物互作模式的方法，综合应用了转录组学、蛋白组学及miRNA组学来研究水稻响应病原物侵染的互作模式的方法。目前还缺乏一种系统完整的能够应用于任何物种的miRNA和转录组学贯穿分析的方法。

发明内容

为克服上述现有技术存在的不足，本发明之目的在于提供一种miRNA测序和转录组测序数据的贯穿分析方法及系统，以实现一种可以适用于任何生物体的miRNA测序和转录组学测序数据的贯穿分析技术。

为达上述及其它目的，本发明提出一种miRNA测序和转录组学测序数据的贯穿分析方法，包括如下步骤：

步骤S1，对样本进行小RNA测序，对小RNA测序数据进行生物信息分析，根据miRNA的表达量，筛选得到差异表达的miRNA；

步骤S2, 对样本进行转录组测序，并对转录组测序数据进行生物信息分析，根据mRNA的表达量，筛选得到差异表达的mRNA；

步骤S3，选择小RNA测序和转录组测序得到的差异表达的miRNA和差异表达的mRNA进行后续关联分析。

优选地，所述的对样本进行小RNA测序并对小RNA测序数据进行生物信息分析。得到样本中miRNA的表达量，根据p0.05且|log2FC|1筛选出差异表达的miRNA。对于两组样本，是直接根据上述标准筛选得到差异表达的miRNA；对于多组样本，是取多个比较组差异表达的miRNA并集。

优选地，步骤1中不仅限于根据miRNA表达量筛选出差异表达的miRNA，还可以对miRNA进行靶基因预测，并且对差异表达的miRNA的靶基因进行GO或者KEGG功能富集分析等。