[发明专利]PCV3 Cap蛋白B细胞线性抗原表位多肽及其筛选与应用在审
申请号: | 201910649264.2 | 申请日: | 2019-07-18 |
公开(公告)号: | CN110283235A | 公开(公告)日: | 2019-09-27 |
发明(设计)人: | 罗满林;吴佳骏;蒋再学;霍礼侠;蒋梅;卜婉迪;刘灿彬 | 申请(专利权)人: | 华南农业大学 |
主分类号: | C07K14/01 | 分类号: | C07K14/01;C07K16/08;G01N33/569;A61K39/12;A61P31/20 |
代理公司: | 桂林市华杰专利商标事务所有限责任公司 45112 | 代理人: | 杨雪梅 |
地址: | 510642 广东省广州市天*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 线性抗原表位 抗原表位 多肽 氨基酸序列 筛选 单克隆抗体筛选 应用 单克隆抗体 表位疫苗 多肽序列 鉴别诊断 诊断试剂 检测 表位 短肽 抗体 制备 鉴别 研究 预防 治疗 | ||
1.PCV3 Cap蛋白B细胞线性抗原表位的多肽序列,其特征在于:包括两条多肽,其氨基酸序列分别为:
PCV3 Cap 47-62:NVISVGTPQNNKPWHA;
PCV3 Cap 136-149:TSKKKHSRYFTPKP;
上述氨基酸的核苷酸序列分别为:
PCV3 Cap 47-62: aacgtcattt ccgttggaac ccctcagaat aacaagccct ggcacgcc 48;
PCV3 Cap 136-149: acttctaaaa aaaaacacag ccgttacttc acccccaaac ca 42。
2.PCV3 Cap 蛋白B细胞线性抗原表位,其特征在于:具有权利要求1所述多肽的氨基酸序列。
3. 根据权利要求2所述的PCV3 Cap 蛋白B细胞线性抗原表位,其特征在于:所述表位为含Alpha、Beta、Turn、coil结构中的至少一种。
4.根据权利要求1所述的PCV3 Cap蛋白B细胞线性抗原表位的多肽序列的筛选方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)根据NCBI上边公布的已知PCV3 Cap蛋白的氨基酸序列,比对分析PCV2与PCV3结构蛋白的主要差别,观察其氨基酸的保守性;
(2)通过DNAstar 7.0软件包中Protean模块Gamier-Robson法和Chou-Fasman法及在线网站SOPMA法对PCV3 Cap蛋白二级结构特征进行了预测;同时采用Kyte-Doolitt法、Emini法和Jameson-Wolf法对蛋白质骨架的亲水性区域、表面可及性、柔韧性和高抗原指数区域进行预测;
(3)借助抗原表位预测在线网站http://tools.iedb.org/bcel对 PCV3 Cap 蛋白B细胞线性抗原表位进行预测,同时使用 https://webs.iiitd.edu.in/raghava/abcpred/ABC_submission.html网站对 PCV3 Cap 的抗原表位进行预测;
(4)通过对DNAstar软件预测结果和在线网站预测的表位信息序列综合分析,为了最大限度地覆盖PCV3 Cap的抗原表位信息,采用随机重叠方式,少许多肽序列相互重叠,最终获得 12 个表位多肽信息,交由吉尔生化上海有限公司合成,多肽合成纯度大于 95%并用BSA偶联;
(5)使用PCV3 Cap 单克隆抗体与抗原表位多肽进行结合反应,筛选出于单抗特异性结合的短肽,获得两个PCV3 Cap 的B细胞线性抗原表位,所获得的表位为含Alpha、Beta、Turn、coil结构中的至少一种,富含正电荷,亲水性强,表面可及性强,抗原指数高;
两条多肽的氨基酸序列分别为:
PCV3 Cap 47-62:NVISVGTPQNNKPWHA;
PCV3 Cap 136-149:TSKKKHSRYFTPKP。
5.根据权利要求2所述的多肽序列的筛选方法,其特征在于:步骤(4)所述的获得 12个表位多肽信息为:
。
6.权利要求1所述的多肽序列在制备PCV2与PCV3型鉴别诊断试剂盒中的应用。
7.权利要求1所述的多肽序列在制备PCV3亚单位疫苗中的应用。
8.权利要求1所述的多肽序列在制备治疗PCV3抗体中的应用。
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