[发明专利]针对丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶B-raf(BRAF)的SRM/MRM测定在审
| 申请号： | 201910658572.1 | 申请日： | 2015-07-13 |
| 公开（公告）号： | CN110412288A | 公开（公告）日： | 2019-11-05 |
| 发明（设计）人： | 大卫·B·克里茨曼;托德·哈姆布拉夫;史诺·塞帕洛姆比尔;辽卫礼 | 申请（专利权）人： | 爱科谱迅病理研究公司 |
| 主分类号： | G01N33/68 | 分类号： | G01N33/68 |
| 代理公司： | 北京润平知识产权代理有限公司 11283 | 代理人： | 刘依云;乔雪微 |
| 地址： | 美国马*** | 国省代码： | 美国;US |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 福尔马林 生物样品 固定的 质谱 修饰 细胞 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 蛋白质样品 石蜡包埋 蛋白质 选择反应监测 组织培养细胞 氨基酸残基 多反应监测 化学保藏 甲醛处理 固定剂 酪氨酸 类生物 磷酸化 丝氨酸 苏氨酸 组织块 肽序列 电离 制备 | ||
1.一种用于检测和定量蛋白质消化物中的BRAF片段肽的含量的试剂在制备用于测量福尔马林固定组织的生物样品中BRAF酪氨酸激酶受体蛋白质BRAF水平的试剂中的应用，其中所述片段肽为如选自以下组成的组中的一种氨基酸序列SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQID NO:3、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9、SEQ IDNO:10和SEQ ID NO:11所示的肽，且
其中所述BRAF片段肽的含量使用质谱进行检测和定量；且
其中所述水平是相对水平或绝对水平。
2.权利要求1所述的应用，其中，在检测和定量所述BRAF片段肽的含量之前对所述蛋白质消化物进行分级。
3.权利要求2所述的应用，其中所述分级的步骤选自液相色谱、纳米反相液相色谱、高效液相色谱或反相高效液相色谱。
4.权利要求1-3中任一项所述的应用，其中所述蛋白质消化物包括蛋白酶消化物。
5.权利要求4所述的应用，其中所述蛋白质消化物包括胰蛋白酶消化物。
6.权利要求1-3中任一项所述的应用，其中所述质谱包括串联质谱、离子阱质谱、三重四极质谱、MALDI-TOF质谱、MALDI质谱和/或飞行时间质谱。
7.权利要求6所述的应用，其中使用的质谱模式是选择反应监测SRM、多反应监测MRM和/或多选择反应监测mSRM。
8.权利要求1-3中任一项所述的应用，其中所述组织是石蜡包埋的组织。
9.权利要求1-3中任一项所述的应用，其中所述组织获自肿瘤。
10.权利要求1-3中任一项所述的应用，其中定量所述BRAF片段肽水平包括比较一种生物样品中BRAF片段肽的含量与不同且单独的生物样品中相同BRAF片段肽的含量。
11.权利要求1-3中任一项所述的应用，其中定量BRAF片段肽水平包括通过与已知含量的添加的内标肽相比较来确定生物样品中所述BRAF片段肽的含量，其中所述生物样品中所述BRAF片段肽的含量与具有相同氨基酸序列的内标肽相比较。
12.权利要求11所述的应用，其中所述内标肽是同位素标记的肽。
13.权利要求12所述的应用，其中所述同位素标记的内标肽包含选自18O、17O、34S、15N、13C、2H和其组合的一种或多种重稳定同位素。
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