[发明专利]侧耳属线粒体nad4L基因的扩增引物及其在鉴定侧耳属物种中的应用有效
申请号: | 201910663593.2 | 申请日: | 2019-07-23 |
公开(公告)号: | CN110358856B | 公开(公告)日: | 2023-04-07 |
发明(设计)人: | 黄文丽;李强;熊川;金鑫;李萍 | 申请(专利权)人: | 四川省农业科学院生物技术核技术研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11;C12Q1/6869;G16B10/00 |
代理公司: | 成都九鼎天元知识产权代理有限公司 51214 | 代理人: | 邓亚君 |
地址: | 610061 四川*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 侧耳 线粒体 nad4l 基因 扩增 引物 及其 鉴定 物种 中的 应用 | ||
1.侧耳属线粒体nad4L基因的扩增引物,其特征在于,其包括上游引物和下游引物,上游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。
2.权利要求1所述的侧耳属线粒体nad4L基因的扩增引物在鉴定侧耳属物种中的应用。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,其包括如下步骤:
根据侧耳属物种的线粒体nad4L基因序列中的保守序列设计上游引物和下游引物;
用所述上游引物和下游引物PCR扩增侧耳属线粒体nad4L基因,若PCR产物中无非特异性扩增,则引物特异性良好;
用所述上游引物和下游引物PCR扩增待测物种线粒体nad4L基因,若PCR产物中无非特异性扩增,则该待测物种为侧耳属物种。
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,上游引物和下游引物之间的扩增片段在200-300bp;引物序列中GC含量为40%-60%。
5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,PCR反应时,30μL体系包括:
6.根据权利要求5所述的应用,其特征在于,PCR程序为:95℃5min;94℃45s,56℃35s,72℃1min,35个循环;72℃延伸10min。
7.根据权利要求6所述的应用,其特征在于,PCR产物用1%的琼脂糖凝胶进行电泳检测,若PCR产物泳道上有且只有一条带,则无非特异扩增产生。
8.根据权利要求7所述的应用,其特征在于,电泳检测后,若无非特异性扩增,回收PCR产物,纯化后测序,测序结果与已知的侧耳属物种nad4L数据库中的物种DNA序列进行比对,构建系统发育树,检验PCR产物序列与已知的侧耳属物种nad4L数据库中序列聚类在一起的物种,若待测物种与数据库中的物种构成单支系,则待测物种鉴定为该物种。
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