[发明专利]一种鉴定斑玉蕈白色菌株单核体的交配型的方法及引物在审

专利信息
申请号: 201910689443.9 申请日: 2019-07-29
公开(公告)号: CN110358858A 公开(公告)日: 2019-10-22
发明(设计)人: 张津京;郝海波;陈辉;汪虹;王倩 申请(专利权)人: 上海市农业科学院
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/645
代理公司: 苏州翔远专利代理事务所(普通合伙) 32251 代理人: 王华
地址: 200000 *** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 交配型 白色菌株 引物 特异性引物 单核体 种鉴定 菌株 扩增 条带 单核体菌株 基因组DNA 单核菌株 精准度 耗时
【权利要求书】:

1.一种鉴定斑玉蕈白色菌株单核体的引物,其特征在于:包括3组引物对,第一组引物对的核苷酸序列如下:

HM1F: 5’- ACCTCTACTTCATCCTTGC-3’;

HM1R: 5’- TCTTGGGCGTCCGTTT-3’;

第二组引物对的核苷酸序列如下:

HM2F: 5’-CGTCCCAGATATTCAACTC-3’;

HM2R: 5’-GAAACCTCCAACGCACT-3’;

第三组引物对的核苷酸序列如下:

HM3F: 5’-CTGGCGTTACCTTCCC-3’;

HM3R: 5’-GTGGTTGTGGCGTGAT-3’。

2.一种鉴定斑玉蕈白色菌株单核体的方法,其特征在于:包括3组引物对,第一组引物对的核苷酸序列如下:

HM1F: 5’- ACCTCTACTTCATCCTTGC-3’;

HM1R: 5’- TCTTGGGCGTCCGTTT-3’;

第二组引物对的核苷酸序列如下:

HM2F: 5’-CGTCCCAGATATTCAACTC-3’;

HM2R: 5’-GAAACCTCCAACGCACT-3’;

第三组引物对的核苷酸序列如下:

HM3F: 5’-CTGGCGTTACCTTCCC-3’;

HM3R: 5’-GTGGTTGTGGCGTGAT-3’;

鉴定斑玉蕈白色菌株单核体的方法包括:提取斑玉蕈白色单核菌株的基因组DNA,然后分别以第一组引物对、第二组引物对和第三组引物对进行PCR扩增,PCR扩增出来的产物用1%-2%的琼脂糖凝胶电泳检测;如果不能用特异性引物扩增出条带的被认为是AxBx交配型菌株,如果能用特异性引物扩增出条带的被认为是AyBy交配型菌株。

3.根据权利要求2所述的鉴定斑玉蕈白色菌株单核体的方法,其特征在于:提取斑玉蕈白色菌株单核体的基因组DNA的方法包括下列步骤:a、将斑玉蕈白色菌株单核体在PDA平板培养基进行培养;b、培养结束后挑取菌丝放在DNA裂解液中,在75-85℃温浴5-10min后即得。

4.根据权利要求2所述的鉴定斑玉蕈白色菌株单核体的方法,其特征在于:PCR扩增反应的体系为:2ul的150ng/ul斑玉蕈白色菌株单核体DNA, 2ul的10umol/L引物,2ul的0.1mmol/LdNTP,0.5ul的高保真酶Pfu,5ul的loading buffer,用ddH2O补齐25ul。

5.根据权利要求2所述的鉴定斑玉蕈白色菌株单核体的方法,其特征在于:PCR扩增反应的条件:94℃预变性5min;94℃变性30s;60℃退火30s;72℃延伸5min;35个循环。

6.根据权利要求2所述的鉴定斑玉蕈白色菌株单核体的方法,其特征在于:将6ulPCR扩增出来的产物与2ul的loading buffer混合,并用体积分数为1-2%琼脂糖凝胶进行电泳,然后用EC3 Imaging System 凝胶成像系统进行拍照;所述琼脂糖凝胶内添加有5ul的GeneFinder荧光染料。

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