[发明专利]一套用于构建桃DNA指纹图谱的SSR引物、应用及构建方法有效
申请号: | 201910695116.4 | 申请日: | 2019-07-30 |
公开(公告)号: | CN110257551B | 公开(公告)日: | 2022-03-22 |
发明(设计)人: | 王力荣;关利平;朱更瑞;方伟超;王新卫;陈昌文;李勇 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院郑州果树研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 郑州中鼎万策专利代理事务所(普通合伙) 41179 | 代理人: | 林新园 |
地址: | 450004 河南*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一套 用于 构建 dna 指纹 图谱 ssr 引物 应用 方法 | ||
1.一套用于构建桃DNA指纹图谱的SSR引物,其特征在于,由10对引物组成:
引物SSR73由如SEQ ID NO.1所示的上游引物和如SEQ ID NO.2所示的下游引物组成;
引物SSR93由如SEQ ID NO.3所示的上游引物和如SEQ ID NO.4所示的下游引物组成;
引物SSR96由如SEQ ID NO.5所示的上游引物和如SEQ ID NO.6所示的下游引物组成;
引物SSR107由如SEQ ID NO.7所示的上游引物和如SEQ ID NO.8所示的下游引物组成;
引物SSR125由如SEQ ID NO.9所示的上游引物和如SEQ ID NO.10所示的下游引物组成;
引物SSR152由如SEQ ID NO.11所示的上游引物和如SEQ ID NO.12所示的下游引物组成;
引物SSR169由如SEQ ID NO.13所示的上游引物和如SEQ ID NO.14所示的下游引物组成;
引物SSR179由如SEQ ID NO.15所示的上游引物和如SEQ ID NO.16所示的下游引物组成;
引物SSR181由如SEQ ID NO.17所示的上游引物和如SEQ ID NO.18所示的下游引物组成;
引物SSR184由如SEQ ID NO.19所示的上游引物和如SEQ ID NO.20所示的下游引物组成。
2.一种如权利要求1所述的SSR引物在构建桃指纹图谱中的应用。
3.一种如权利要求1所述的SSR引物在桃品种鉴定方面的应用。
4.一种利用权利要求1所述的SSR引物构建桃DNA指纹图谱的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)DNA提取:采用常规CTAB法提取样品DNA;
(2)PCR 扩增:以待测桃的基因组DNA为模板,用SSR引物对进行PCR扩增,获得PCR扩增产物;
(3)3730XL DNA基因分析仪检测;
(4)基因分型:样品的每个SSR位点的等位变异采用扩增片段大小的形式表示。
5.根据权利要求4所述的利用SSR引物构建桃DNA指纹图谱的方法,其特征在于,PCR扩增的反应体系为:10×PCR缓冲液1 µL、dNTP混合物0.8 µL、上下游引物的混合物0.6 µL、20-30 ng/µL DNA样品1 µL、5 U/µL Taq DNA聚合酶0.1 µL、超纯水6.5 µL。
6.根据权利要求4所述的利用SSR引物构建桃DNA指纹图谱的方法,其特征在于,PCR扩增的反应程序为:95 ℃预变性5 min;95 ℃变性30 s,56 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 s,共35个循环;4 ℃保存备用。
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