[发明专利]Illumina二代测序平台文库构建引入分子标签的方法、接头序列及应用在审
申请号: | 201910739362.5 | 申请日: | 2019-08-12 |
公开(公告)号: | CN110628889A | 公开(公告)日: | 2019-12-31 |
发明(设计)人: | 陈鑫泽 | 申请(专利权)人: | 远辰生物科技(苏州)有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6876 | 分类号: | C12Q1/6876;C12Q1/6806 |
代理公司: | 31330 上海海钧知识产权代理事务所(特殊普通合伙) | 代理人: | 姜波 |
地址: | 215021 江苏省苏州市苏州工业园区*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 接头序列 测序平台 试剂盒 构建 建库 文库 诊断试剂盒 分子标签 碱基序列 随机碱基 文库构建 碱基 配对 制备 疾病 引入 申请 应用 成功 | ||
1.一种适用于Illumina二代测序平台的文库构建的接头序列,其特征在于,所述接头序列包括:5’-P-E-F-Q-3’,其中,P为测序平台配对序列、E为随机碱基序列、F为给定碱基序列、Q为Tn5转座酶末端识别序列。
2.根据权利要求1所述的接头序列,其特征在于,所述E为5-10个碱基组成的随机碱基序列,所述F为3-5个碱基组成的给定碱基序列。
3.根据权利要求1所述的接头序列,其特征在于,P选自:
1)AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC,或
2)CAAGCAGAAGACGGCATACGAGAT。
4.根据权利要求1所述的接头序列,其特征在于,Q选自:
1)TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAG,或
2)GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAG。
5.根据权利要求1-4中任意一项所述的接头序列,其特征在于,所述5’-P-E-F-Q-3’选自SEQ ID NO.1-SEQ ID NO.128中的任意一种或更多种。
6.一种适用于Illumina二代测序平台的文库构建的接头序列的设计方法,其特征在于,包括:设计如下两个不同接头序列:
接头序列1:5’-P1-E1-F1-Q1-3’
接头序列2:5’-P2-E2-F2-Q2-3’
其中,P1、P2为如权利要求1所述的测序平台配对序列、E1、E2为如权利要求1所述的随机碱基序列、F1、F2为如权利要求1所述的既定碱基序列、Q1、Q2为如权利要求1所述的Tn5转座酶末端识别序列。
7.根据权利要求6所述的设计方法,其特征在于,在一种优选实施例中,所述5’-P1-E1-F1-Q1-3’选自SEQ ID NO.1-SEQ ID NO.64中的任意一种或更多种;所述5’-P2-E2-F2-Q2-3’选自SEQ ID NO.65-SEQ ID NO.128中的任意一种或更多种。
8.一种适用于Illumina二代测序平台的文库构建中引入分子标签方法,其特征在于,包括:
采用权利要求6所述接头序列1、所述接头序列2组装Tn5转座酶复合体;
使用组装后的Tn5转座酶复合体对DNA样本进行打断;打断的DNA分子两边分别标记E1-F1、E2-F2;
对打断后的DNA片段进行PCR扩增,纯化扩增产物。
9.一种试剂盒,其特征在于,包括权利要求1所述适用于Illumina二代测序平台的文库构建的接头序列5’-P-E-F-Q-3’。
10.根据权利要求9所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括序列:
5’-Phos-CTGTCTCTTATACACATCT-3’,和/或:
5’-AATGATACGGCGACCACCGA-3’、5’-CAAGCAGAAGACGGCATACGA-3’。
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