[发明专利]监测mRNA Poly(A)尾长度的方法及应用有效
申请号: | 201910758103.7 | 申请日: | 2019-08-16 |
公开(公告)号: | CN110452951B | 公开(公告)日: | 2021-04-13 |
发明(设计)人: | 苏晓晔;李爽;彭育才;刘隽;向晟楠;刘琪 | 申请(专利权)人: | 珠海丽凡达生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/00 | 分类号: | C12Q1/00;C12Q1/68 |
代理公司: | 北京超凡宏宇专利代理事务所(特殊普通合伙) 11463 | 代理人: | 张金铭 |
地址: | 519000 广东省珠海市横琴新区环岛东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 监测 mrna poly 长度 方法 应用 | ||
1.监测mRNA Poly(A)尾长度的方法在mRNA质量控制中的应用,其特征在于,所述方法包括:在mRNA加尾反应中,通过测定ATP消耗量和/或PPi生成量,得到mRNA Poly(A)尾长度;
所述mRNA Poly(A)尾长度=ATP消耗量/mRNA的反应浓度;
所述mRNA Poly(A)尾长度=PPi生成量/mRNA的反应浓度;
通过测定标准加尾反应中不同反应时间点的ATP消耗量,建立标准mRNA加尾长度和反应时间的标准曲线,利用所述标准曲线,在mRNA加尾反应中得到mRNA Poly(A)尾长度;
所述ATP消耗量的测定方法为:高效液相色谱法或凝胶电泳法;
在标准加尾反应中,所述标准mRNA的反应浓度为0.6µM;在标准加尾反应中,所述ATP的起始浓度为500µM;
所述mRNA Poly(A)尾是指真核生物的mRNA 3’末端都有由100~200个A组成的Poly(A)尾巴;
所述ATP消耗量=ATP的起始浓度×ATP消耗量百分比,所述ATP消耗量百分比=(C0-Ct)/C0,所述C0为反应时间为0分钟时的ATP实时检测浓度,所述Ct为不同反应时间点的ATP实时检测浓度。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,通过测定标准加尾反应中不同时间点的PPi生成量,建立标准mRNA加尾长度和反应时间的标准曲线,利用所述标准曲线,在mRNA加尾反应中得到mRNA Poly(A)尾长度。
3.根据权利要求1或2所述的应用,其特征在于,包括以下步骤:
(a)搭建标准mRNA的加尾反应,分别在0分钟、5分钟、10分钟、15分钟、20分钟、25分钟、30分钟和35分钟取样,终止加尾反应后测定ATP消耗量,得到ATP消耗量与时间的对应关系;
其中,ATP消耗量=ATP的起始浓度×ATP消耗量百分比;
所述ATP消耗量百分比=(C0-Ct)/C0;
所述C0为反应时间为0分钟时的ATP实时检测浓度,所述Ct为不同反应时间点的ATP实时检测浓度;
(b)根据mRNA Poly(A)尾长度=ATP消耗量/mRNA的反应浓度,其中,ATP消耗量=ATP的起始浓度×ATP消耗量百分比,通过步骤(a)得到的ATP消耗量与时间的对应关系,建立标准mRNA加尾长度和反应时间的标准曲线;
(c)根据步骤(b)得到的标准mRNA加尾长度和反应时间的标准曲线,在mRNA加尾反应中,通过mRNA Poly(A)尾长度=(ATP的起始浓度×(C0-Ct)/C0)/mRNA的反应浓度监测mRNAPoly(A)尾长度。
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