[发明专利]非洲猪瘟病毒荧光型RAA检测试剂盒在审
申请号: | 201910773232.3 | 申请日: | 2019-08-21 |
公开(公告)号: | CN110358867A | 公开(公告)日: | 2019-10-22 |
发明(设计)人: | 赵林萍;娄亚坤;杨楠;付燕峰;梁小红;任宝红;崔兴涛;曾小宇 | 申请(专利权)人: | 郑州中道生物技术有限公司;河南中标检测服务有限公司;郑州大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6844 |
代理公司: | 北京迎硕知识产权代理事务所(普通合伙) 11512 | 代理人: | 张群峰;吕良 |
地址: | 450000 河南省郑州市*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 非洲猪瘟病毒 检测试剂 试剂盒 荧光 探针 现场快速检测 荧光淬灭基团 核酸外切酶 特异性引物 报告荧光 淬灭基团 恒温条件 技术手段 四氢呋喃 荧光基团 荧光信号 扩增子 荧光团 检测 染料 靶标 残基 淬灭 碱基 裂解 筛查 位点 灵敏 | ||
1.一种非洲猪瘟病毒荧光型RAA检测试剂盒,包括特异性引物ASFV-F和ASFV-R,以及标记有THF残基的RAA-exo探针ASFV-P,探针标记的报告荧光染料为FAM,标记的荧光淬灭基团为BHQ-1;其中特异性引物和RAA-exo探针序列如下:
ASFV-F:5′-TCGCCGAAGGGAATGGATACTGAGGGAATA-3′;
ASFV-R:5′-AGGGGATAAAATGACTGGATATAAGCACTTGGT-3′;
ASFV-P:5′-TGCGTATCATTTTCATCGGTAAGAATAGGTT[FAM-dT][THF]C[BHQ1-dT]TTGGTGCGGCTTGTGC-3′。
2.根据权利要求1所述的试剂盒,还包括荧光RAA反应单元、Buffer A、Buffer B,阳性对照以及阴性对照。所述的荧光RAA反应单元,含有重组酶、单链结合蛋白、链置换DNA聚合酶、核酸外切酶冻干酶粉;Buffer A为水解缓冲液;Buffer B为醋酸镁溶液;阳性对照为含有非洲猪瘟病毒p72基因的pUC57-p72质粒,阴性对照为空载体pUC57质粒。
3.根据权利要求2所述的一种非洲猪瘟病毒荧光型RAA检测试剂盒的制备方法,其特征在于,包含以下步骤:
(1)人工合成非洲猪瘟病毒p72基因全长序列(登录号:MH713612.1)克隆到pUC-57载体上,经大肠杆菌工程菌纯培养后提取质粒作为阳性对照;
(2)权利要求1中的引物组和探针制备:
根据p72基因的保守区,设计特异性引物ASFV-F和ASFV-R,以及RAA-exo探针ASFV-P,用四氢呋喃(THF残基),dT-荧光团和dT-淬灭团取代靶标扩增子序列内的碱基,THF残基的5′端方向标记的报告荧光染料为FAM,THF残基的3′端方向标记荧光淬灭基团为BHQ-1,试剂中的核酸外切酶可在THF位点裂解探针,从而分离荧光基团和淬灭基团并产生荧光信号;
(3)重组酶、单链结合蛋白、链置换DNA聚合酶、核酸外切酶冻干酶粉、水解缓冲液、醋酸镁溶液及去离子水,为商品化制备。
4.利用权利要求2所述的非洲猪瘟病毒试剂盒快速检测非洲猪瘟病毒的方法,其特征在于,包含以下步骤:
1)在荧光RAA反应单元中加入45.5μL水解缓冲液,2μL阳性对照/阴性对照/待检核酸,在反应管中加2.5μL醋酸镁溶液,盖上盖子离心,上下颠倒混匀,离心10秒,立即检测;反应程序为:39℃40秒;39℃30秒40个循环,此处采集荧光信号,20min可完成检测;
2)结果判定
①阳性对照:有典型的扩增曲线出现,出峰时间小于15min(Ct值≤30),为有效结果;
②阴性对照:无扩增曲线出现,或出峰时间≥20min(Ct值≥40),为有效结果;
③被检样本:
a.若出峰时间≤17.5min(Ct值<35),判断为阳性;
b.若出峰时间≥20min(Ct值≥40),判断为阴性;
c.若17.5min<出峰时间<20min(35<Ct值<40),判为可疑,需重复检测进行确认;再次检测结果仍然是17.5min<出峰时间<20min(35<Ct值<40),应参照阴性对照出峰时间(Ct值),若阴性对照出峰时间≥20min(Ct值≥40),则判断为阳性。
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