[发明专利]一种用于FFPE样本DNA质控的试剂盒及检测方法

权利要求书

1.一种用于FFPE样本中DNA质控的试剂盒，其特征在于，该检测试剂盒包括用于扩增的试剂包括以下3条引物和1条探针，其中3条引物分别为：

SEQ ID NO.：1：CCAAGAGGTAGAGATCATCAAGAGC；

SEQ ID NO.：2：TCCATTAGACCAGAAAAGACAGCA；

SEQ ID NO.：3：CCAAGAATCAAGACAGACACAAA；

1条探针为：SEQ ID NO.：4：FAM-TTGATGGGACGTATT-MGB；

其中SEQ ID NO.：1与SEQ ID NO.：2引物得到扩增子1，以及SEQ ID NO.：1与SEQ IDNO.：3引物对得到扩增子2，扩增子1长度为108bp，扩增子2长度为212bp，并且扩增1和扩增子2在人类基因组(hg19)上存在多个拷贝，且分布于不同的染色体上。

2.根据权利要求1所述的一种用于FFPE样本中DNA质控的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒仅通过3条引物和1条探针，即可有效的评估FFPE样本中DNA的质量。

3.根据权利要求1所述的一种用于FFPE样本中DNA质控的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包含如下扩增体系：

体系1包含如下组分：1×PCR预混液，上游引物SEQ ID NO.：1，下游引物SEQ ID NO.：2，探针SEQ ID NO.：4，模板DNA。

体系2包含如下组分：1×PCR预混液，上游引物SEQ ID NO.：1，下游引物SEQ ID NO.：3，探针SEQ ID NO.：4，模板DNA。

4.一种用于FFPE样本DNA质控的检测方法，其特征在于，用权利要求1-3任一所述检测试剂盒实施，包含以下步骤：

1)配制体系1和体系2的PCR反应液；

2)配制包含待评估标本以及基于标准品的标准曲线反应体系；

3)进行定量PCR扩增反应。

4)计算扩增子1和扩增子2的CT值以及待评估标本的浓度，进行标本质量的评估。

5.根据权利要求4所述的一种用于FFPE样本DNA质控的检测方法，其特征在于，所述评估标本质量的标准如下：

1)CT值差值小于2，DNA完整性好；

2)CT值差异介于2-4，DNA存在降解，但是仍可用于标准实验；

3)CT差值介于4-6，DNA降解，用于下游实验存在较大风险；

4)CT差值小于6，DNA降解严重，不建议进行后续实验。