[发明专利]一种VIM型和SPM型金属酶铜绿假单胞菌的识别模型、构建方法及应用有效
申请号: | 201910786373.9 | 申请日: | 2019-08-24 |
公开(公告)号: | CN110501414B | 公开(公告)日: | 2022-03-11 |
发明(设计)人: | 李进;鲁卫平;胡韦维;黎敏;黄庆;邓少丽 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军陆军特色医学中心 |
主分类号: | G01N27/62 | 分类号: | G01N27/62;G06K9/62 |
代理公司: | 北京同恒源知识产权代理有限公司 11275 | 代理人: | 杨柳岸 |
地址: | 400042 重*** | 国省代码: | 重庆;50 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 vim spm 金属 铜绿 假单胞菌 识别 模型 构建 方法 应用 | ||
1.一种VIM型和SPM型金属酶铜绿假单胞菌的识别模型的构建方法,其特征在于,具体步骤如下:
(1)首先将VIM型和SPM型菌株质谱结果导入SARAMIS数据库,通过对两者质谱峰进行聚类分析,发现两者之间存在部分有差异的质谱峰;然后通过LaunchPad软件将两者质谱峰进行比较分析,得到17个高信号强度峰作为两者的共有质量峰;
(2)为筛选VIM型和SPM型菌株之间有差异的特征峰,再次利用LaunchPad软件分别比较VIM型菌株和非VIM型以及SPM型菌株和非SPM型的质谱特征峰;
(3)最后选取VIM型菌株的4个特征峰和非VIM型菌株的3个特征峰作为鉴定VIM型的模型,选取SPM型菌株的2个特征峰和非SPM型菌株的2个特征峰作为鉴定SPM型的模型;
步骤(1)中,所述的17个高信号强度峰包含:
3601m/z,4434m/z,4544m/z,4849m/z,4992m/z,5114m/z,5210m/z,5737m/z,
6046m/z,6348m/z,6676m/z,7203m/z,7595m/z,8786m/z,9089m/z,9987m/z和10229m/z;
步骤(3)中,VIM型菌株的4个特征峰为:
3230m/z,3409m/z,5450m/z,7329m/z,非VIM型菌株的3个特征峰为3429m/z,5490m/z,7390m/z;
步骤(3)中,SPM型菌株的2个特征峰为3663m/z,6264m/z,非SPM型菌株的2个特征峰为4068m/z,4282m/z。
2.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,步骤(1)中,随机选择15株VIM型和15株SPM型菌株通过SARAMIS软件对两种菌株质量相同的峰数量进行聚类分析。
3.权利要求1所述识别模型在VIM型和SPM型金属酶铜绿假单胞菌鉴别中的应用。
4.一种快速、准确鉴别VIM型和SPM型金属酶铜绿假单胞菌的方法,是利用权利要求1所述识别模型,通过VITEK MS SARAMIS软件对菌株的质谱特征峰进行分析,从而对VIM型和SPM型进行区分。
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